RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586397.5

PRKAR1A-211, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKAR1A, Length 1,940 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1A-211ENST00000586397 PPFIBP2Q8ND30 876 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 USP7Q93009 1102 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CMTM5Q96DZ9 223 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC6A18Q96N87 628 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR4K3Q96R72 315 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 UCN2Q96RP3 112 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MIPEPQ99797 713 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CD320Q9NPF0 282 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SNX6Q9UNH7 406 aa8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 E7EQ34 232 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MANBAO00462 879 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 FFAR3O14843 346 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SCAMP1O15126 338 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 GPR42O15529 346 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PI15O43692 258 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 KDM1AO60341 852 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ULK1O75385 1050 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 WFS1O76024 890 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RASGRP1O95267 797 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 TNFP01375 233 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 JUPP14923 745 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PIK3R1P27986 724 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 HOXA6P31267 233 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ACTR1BP42025 376 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ACTR1AP61163 376 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZNF33BQ06732 778 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRKG2Q13237 762 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 E2F2Q14209 437 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CLCA4Q14CN2 919 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ABRAXAS2Q15018 415 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CYP2A13Q16696 494 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 XKR6Q5GH73 641 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ASRGL1Q7L266 308 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SPATA19Q7Z5L4 167 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 IQCHQ86VS3 1027 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR2T11Q8NH01 316 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZFAND2BQ8WV99 257 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 KLHL29Q96CT2 875 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MARK4Q96L34 752 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 FERD3LQ96RJ6 166 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MENTQ9BUN1 341 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 EHD1Q9H4M9 534 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CAPN10Q9HC96 672 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 DYRK1BQ9Y463 629 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 LRP4O75096 1905 aa8.55□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 VCANP13611 3396 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 OR52A4PA6NMU1 304 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 MEI4A8MW99 385 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SLC28A1O00337 649 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RGS14O43566 566 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRAMEF4O60810 478 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PEX11AO75192 247 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 IDO1P14902 403 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 NDUFS1P28331 727 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PTPN4P29074 926 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 HNF4AP41235 474 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CASP2P42575 452 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 BLKP51451 505 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 STX1BP61266 288 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ERVK-8P63133 956 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 FZD2Q14332 565 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 KRT33BQ14525 404 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 HERC3Q15034 1050 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 NR6A1Q15406 480 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 RPE65Q16518 533 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 GSTA3Q16772 222 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 CMPK2Q5EBM0 449 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa8.54□□□□□ -1.04
PRKAR1A-211ENST00000586397 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms