RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585313.5

IFT20-215, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

APPRIS P4 TSL 3 BASIC

Gene IFT20, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-215ENST00000585313 NR6A1Q15406 480 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RPE65Q16518 533 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 IMPG1Q17R60 797 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 XKR6Q5GH73 641 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 C6orf136Q5SQH8 315 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FRG2Q64ET8 278 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ATG9BQ674R7 924 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SCIMPQ6UWF3 145 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MIER2Q8N344 545 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SFRP1Q8N474 314 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SMPDL3AQ92484 453 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 REPS1Q96D71 796 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KLHDC7BQ96G42 594 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CAMK1GQ96NX5 476 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FRG2BQ96QU4 278 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RTKNQ9BST9 563 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 BRINP2Q9C0B6 783 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ASIC5Q9NY37 505 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CIDEBQ9UHD4 219 aa16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 B2RBV5 119 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GYG2O15488 501 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PEX11AO75192 247 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NPPBP16860 134 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GPX3P22352 226 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RAB28P51157 221 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 BLKP51451 505 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 EMX2Q04743 252 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 LAPTM5Q13571 262 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KIF19Q2TAC6 998 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PAGE2BQ5JRK9 111 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RINLQ6ZS11 566 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SNX32Q86XE0 403 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 HID1Q8IV36 788 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FRMD1Q8N878 549 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 MFSD2AQ8NA29 543 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GPBAR1Q8TDU6 330 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC5A11Q8WWX8 675 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SELENOMQ8WWX9 145 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NEIL2Q969S2 332 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PRDM8Q9NQV8 689 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TBC1D29Q9UFV1 150 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa16.06■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 A6NCN8 305 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PDYNP01213 254 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 DCNP07585 359 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ACPPP15309 386 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CD22P20273 847 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ACTR1BP42025 376 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 CPA2P48052 419 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ACTR1AP61163 376 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PRKG2Q13237 762 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FZD2Q14332 565 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KRT33BQ14525 404 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 RD3Q7Z3Z2 195 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TMPRSS11BQ86T26 416 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 PARGQ86W56 976 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 KIF2BQ8N4N8 673 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 FNDC5Q8NAU1 212 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TSPEARQ8WU66 669 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 UBE2E3Q969T4 207 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC6A18Q96N87 628 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 IL17FQ96PD4 163 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.05■□□□□ 0.16
IFT20-215ENST00000585313 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms