RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHG6Q3KR16 790 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 STON2Q8WXE9 905 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 PMEPA1Q969W9 287 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 SLC13A2Q13183 592 aa20.87■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 GPR151Q8TDV0 419 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.86■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
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PTPRM-211ENST00000580170 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRM-211ENST00000580170 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.85■□□□□ 0.93
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