RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.88□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 MPP5Q8N3R9 675 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALNT16Q8N428 558 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.88□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.88□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ERVK-10P10266 1014 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRM3P20309 590 aa6.87□□□□□ -1.31
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC6A20Q9NP91 592 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SAMD15Q9P1V8 674 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOX13Q9UN79 622 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.87□□□□□ -1.31
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.87□□□□□ -1.31
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