RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 FCRL4Q96PJ5 515 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KLHL25Q9H0H3 589 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 APMAPQ9HDC9 416 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 SNX15Q9NRS6 342 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FOXJ2Q9P0K8 574 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ADAMTS20P59510 1910 aa25.18■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TARM1B6A8C7 271 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KRT37O76014 449 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TUBBP07437 444 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CCND1P24385 295 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TYK2P29597 1187 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CDKL1Q00532 357 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CSHL1Q14406 222 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PPP1R3AQ16821 1122 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 AGTRAPQ6RW13 159 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 NMRAL1Q9HBL8 299 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 OARD1Q9Y530 152 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KLK4Q9Y5K2 254 aa25.17■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CD1DP15813 335 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 MAGP20916 626 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PSMB5P28074 263 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ABATP80404 500 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TSNQ15631 228 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 EMBQ6PCB8 327 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FIGLAQ6QHK4 219 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PPFIBP2Q8ND30 876 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PMEPA1Q969W9 287 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FBXL8Q96CD0 374 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 MIPEPQ99797 713 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 IKZF3Q9UKT9 509 aa25.16■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FREM2Q5SZK8 3169 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
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NME3-209ENST00000566600 GUCA1CO95843 209 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 C2P06681 752 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ANXA5P08758 320 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CSRP3P50461 194 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 GPR19Q15760 415 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ICE2Q659A1 982 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ADGRD1Q6QNK2 874 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FAM20CQ8IXL6 584 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 SPATA6LQ8N4H0 392 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ISL2Q96A47 359 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 MTBPQ96DY7 904 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ACAT2Q9BWD1 397 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PPCSQ9HAB8 311 aa25.15■■□□□ 1.62
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NME3-209ENST00000566600 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ANKMY1Q9P2S6 941 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TAC3Q9UHF0 121 aa25.15■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 SERTAD3Q9UJW9 196 aa25.15■■□□□ 1.62
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NME3-209ENST00000566600 ACACAQ13085 2346 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 A0A096LPK6 155 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CCDC189A1A4V9 331 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 STMND1H3BQB6 276 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 GRIA3P42263 894 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 HNMTP50135 292 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 TBPL1P62380 186 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 NAE1Q13564 534 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 ZIC1Q15915 447 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 FAM83EQ2M2I3 478 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CDKL4Q5MAI5 379 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KCNE4Q8WWG9 221 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 KIAA1191Q96A73 305 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 MED8Q96G25 268 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 DPH1Q9BZG8 443 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 RAXQ9Y2V3 346 aa25.14■■□□□ 1.62
NME3-209ENST00000566600 PCM1Q15154 2024 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 TRIM49D1C9J1S8 452 aa25.13■■□□□ 1.61
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NME3-209ENST00000566600 LIPCP11150 499 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 GPSM1Q86YR5 675 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 OR56A3Q8NH54 315 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 STAG3L4Q8TBR4 150 aa25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NME3-209ENST00000566600 EGFL8Q99944 293 aa25.13■■□□□ 1.61
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