RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557014.1

GTF3AP2-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP2, Length 266 nt, Biotype transcribed processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATE1O95260 518 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NDST3O95803 873 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 HEXBP07686 556 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TPBGLP0DKB5 382 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ATP1A3P13637 1013 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAGP20916 626 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FBLP22087 321 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FDXRP22570 491 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CXCR2P25025 360 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SHMT2P34897 504 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTGER1P34995 402 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PTGS2P35354 604 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PCK1P35558 622 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 HMGCLP35914 325 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CD96P40200 585 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 RFC3P40938 356 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 KIR2DL3P43628 341 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 EMP2P54851 167 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NUP107P57740 925 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PPP2R2BQ00005 443 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FANCCQ00597 558 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 GBE1Q04446 702 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZBTB17Q13105 803 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TUBA3CQ13748 450 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ITGA9Q13797 1035 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 KEAP1Q14145 624 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 DPYSL3Q14195 570 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 GRM7Q14831 915 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR1C1Q15619 314 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LONRF2Q1L5Z9 754 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 BCL7AQ4VC05 210 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 BOLA3Q53S33 107 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ACER2Q5QJU3 275 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ERICH6BQ5W0A0 696 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMEM211Q6ICI0 200 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CCDC70Q6NSX1 233 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TUBA3EQ6PEY2 450 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 KDELC1Q6UW63 502 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARSKQ6UWY0 536 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NAPRTQ6XQN6 538 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TMTC1Q8IUR5 882 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SLC25A41Q8N5S1 370 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CNTD1Q8N815 330 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 MDS2Q8NDY4 140 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ARMC2Q8NEN0 867 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR5AR1Q8NGP9 310 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FAM57AQ8TBR7 257 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 HM13Q8TCT9 377 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF398Q8TD17 642 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 DENND1AQ8TEH3 1009 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 RND1Q92730 232 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FATE1Q969F0 183 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 DCUN1D1Q96GG9 259 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SEC16BQ96JE7 1060 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 BTBD6Q96KE9 485 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 FRMD6Q96NE9 622 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NPAS2Q99743 824 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF700Q9H0M5 742 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 COG4Q9H9E3 785 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 ZNF304Q9HCX3 659 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 NEUROD4Q9HD90 331 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 DMRT3Q9NQL9 472 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 RIC8BQ9NVN3 520 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TAB2Q9NYJ8 693 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CIDEBQ9UHD4 219 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TEKT2Q9UIF3 430 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 GNPTGQ9UJJ9 305 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 PLAGL1Q9UM63 463 aa2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 CR1P17927 2039 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 A0A1W2PQ72 361 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 KLHL33A6NCF5 533 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 OR2W5A6NFC9 320 aa2.68□□□□□ -1.98
GTF3AP2-201ENST00000557014 USP27XA6NNY8 438 aa2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms