RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550233.1

TMEM116-211, Transcript of transmembrane protein 116, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene TMEM116, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM116-211ENST00000550233 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 SPRY4Q9C004 299 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 CARD9Q9H257 536 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 ECT2Q9H8V3 914 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 MIS18AQ9NYP9 233 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 PKD2L2Q9NZM6 624 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 B3GAT1Q9P2W7 334 aa4.56□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.56□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 ZNF510Q9Y2H8 683 aa4.56□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 TMEM129A0AVI4 362 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 OR5K3A6NET4 321 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 F8WDY8 70 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 NPIPA3F8WFD2 350 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 SOCS6O14544 535 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 ATP6V1G1O75348 118 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 BCAR3O75815 825 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 CXCL14O95715 111 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 TSPY10P0CW01 314 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 KRT3P12035 628 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 EFHC1Q5JVL4 640 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 FAM166AQ6J272 317 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 TRNP1Q6NT89 227 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 Q6ZSV7 163 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 ARHGEF25Q86VW2 580 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 FAM114A1Q8IWE2 563 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.55□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa4.55□□□□□ -1.68
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TMEM116-211ENST00000550233 MLLT10P55197 1068 aa4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 HUNKP57058 714 aa4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 ELP6Q0PNE2 266 aa4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 MTX1Q13505 466 aa4.54□□□□□ -1.68
TMEM116-211ENST00000550233 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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