RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TMEM233B4DJY2 109 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 E7EQ34 232 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KLF11O14901 512 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GDF9O60383 454 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NPHS1O60500 1241 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZNF883P0CG24 379 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NEFHP12036 1026 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CD59P13987 128 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NPPBP16860 134 aa7.87□□□□□ -1.15
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CS-216ENST00000549221 CD22P20273 847 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NDUFS1P28331 727 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LSP1P33241 339 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SHMT2P34897 504 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LSSP48449 732 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SLC1A6P48664 564 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SEC24CP53992 1094 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 FOXA1P55317 472 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ERVPABLB-1P60509 514 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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CS-216ENST00000549221 SH3BP2P78314 561 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CLCQ05315 142 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TRAF3Q13114 568 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 STX3Q13277 289 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GTF2H2Q13888 395 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ARHGAP19Q14CB8 494 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PLCL1Q15111 1095 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CSRP2Q16527 193 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PROX2Q3B8N5 592 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PERM1Q5SV97 790 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CGB2Q6NT52 195 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GUSBP11Q6P575 273 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TRIM73Q86UV7 250 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LRRC34Q8IZ02 419 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TCAIMQ8N3R3 496 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SNX31Q8N9S9 440 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR2A1Q8NGT9 310 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR10G6Q8NH81 332 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LRRC8CQ8TDW0 803 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 AGAP11Q8TF27 550 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ZFPM2Q8WW38 1151 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ATL1Q8WXF7 558 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SMPDL3AQ92484 453 aa7.87□□□□□ -1.15
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CS-216ENST00000549221 CCDC126Q96EE4 140 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KCNA7Q96RP8 456 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EDEM2Q9BV94 578 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ACAT2Q9BWD1 397 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SLC32A1Q9H598 525 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 DNAJC11Q9NVH1 559 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 NCDNQ9UBB6 729 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OPTCQ9UBM4 332 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TAC3Q9UHF0 121 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ASXL3Q9C0F0 2248 aa7.87□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR5K3A6NET4 321 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 LILRA5A6NI73 299 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 TMEM114B3SHH9 223 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 B4GAT1O43505 415 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
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CS-216ENST00000549221 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
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CS-216ENST00000549221 JUNP05412 331 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CDH1P12830 882 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 UGT2B7P16662 529 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 GRK2P25098 689 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CSF2RBP32927 897 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 OR1D5P58170 312 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 CFHR1Q03591 330 aa7.86□□□□□ -1.15
CS-216ENST00000549221 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.155e-17■■■□□ 18.8
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