RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 RIPK2O43353 540 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TOM1O60784 492 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NDUFS7O75251 213 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SERPINI2O75830 405 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IL1BP01584 269 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RPSAP08865 295 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CLTAP09496 248 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GABRB1P18505 474 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SP100P23497 879 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ATP5DP30049 168 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ALDH3A1P30838 453 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CHRNA3P32297 505 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 STX2P32856 288 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PIK3CAP42336 1068 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PCYT1AP49585 367 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GALCP54803 685 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RPL26P61254 145 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ASIC1P78348 528 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TFAP4Q01664 338 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 KLHL30Q0D2K2 578 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IRF3Q14653 427 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ASIC2Q16515 512 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 COL24A1Q17RW2 1714 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PMS2CLQ68D20 193 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 CGB2Q6NT52 195 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 C11orf63Q6NUN7 778 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SPATA21Q7Z572 469 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 ARHGAP18Q8N392 663 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 LZICQ8WZA0 190 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IRGQQ8WZA9 623 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RAD54LQ92698 747 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 TSG101Q99816 390 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 PCGF1Q9BSM1 259 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SPRY4Q9C004 299 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TRIM7Q9C029 511 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 POLD4Q9HCU8 107 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SIX2Q9NPC8 291 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TXLNGQ9NUQ3 528 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SETD4Q9NVD3 440 aa4.93□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 GMEB1Q9Y692 573 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PFASO15067 1338 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 FRMPD4Q14CM0 1322 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.93□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ZNF831Q5JPB2 1677 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 NOTCH4Q99466 2003 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 C1orf226A1L170 272 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CDRT15L2A8MXV6 281 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 LACTBL1A8MY62 500 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CYTH3O43739 400 aa4.92□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 ABHD2P08910 425 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 CLTBP09497 229 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 H2AFZP0C0S5 128 aa4.92□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 UCHL3P15374 230 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TMEM11P17152 192 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GM2AP17900 193 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
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TRDN-204ENST00000542443 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 TRAF2Q12933 501 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 GIT2Q14161 759 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 SLC15A2Q16348 729 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PCGF3Q3KNV8 242 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 AMZ1Q400G9 498 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ZNF585BQ52M93 769 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 ODF2Q5BJF6 829 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa4.92□□□□□ -1.62
TRDN-204ENST00000542443 LRIF1Q5T3J3 769 aa4.92□□□□□ -1.62
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