RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531129.5

GPATCH4-215, Transcript of G-patch domain containing 4, human

TSL 5

Gene GPATCH4, Length 532 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PCM1	Q15154	2024 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FITM1	A5D6W6	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FFAR3	O14843	346 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	GPR42	O15529	346 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	F10	P00742	488 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	APOA4	P06727	396 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ADRA1D	P25100	572 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MFAP5	Q13361	173 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TLR1	Q15399	786 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PSMF1	Q92530	271 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MARVELD3	Q96A59	401 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC1	Q99614	292 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CREBBP	Q92793	2442 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129		A0A1W2PPV9	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TARM1	B6A8C7	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	JRK	O75564	520 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SUN1	O94901	812 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	C1orf105	O95561	183 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	IFNB1	P01574	187 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RPN2	P04844	631 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	CELA2A	P08217	269 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	KCNK10	P57789	538 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRAME	P78395	509 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ATG9B	Q674R7	924 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OR2A1	Q8NGT9	310 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MIEF2	Q96C03	454 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PANX2	Q96RD6	677 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TAAR6	Q96RI8	345 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	LMF1	Q96S06	567 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	OLAH	Q9NV23	265 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	C3orf18	Q9UK00	162 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GPATCH4-215	ENST00000531129	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129		E7EVH7	732 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129		F8W8V4	182 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	GAS8	O95995	478 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	HP	P00738	406 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	STS	P08842	583 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	COX6A1	P12074	109 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	ACPP	P15309	386 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	PTMS	P20962	102 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	PER3	P56645	1201 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	CRADD	P78560	199 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	OCA2	Q04671	838 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	SNX1	Q13596	522 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	TTC23L	Q6PF05	361 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GPATCH4-215	ENST00000531129	CNST	Q6PJW8	725 aa		11.08	□□□□□ -0.64

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