RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507692.5

SNHG4-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 5

Gene SNHG4, Length 575 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-205	ENST00000507692	PNLIPRP1	P54315	467 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CDKN2D	P55273	166 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IL2	P60568	153 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MC1R	Q01726	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RHD	Q02161	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GUCY2D	Q02846	1103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SP140	Q13342	867 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TRADD	Q15628	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	HECTD2	Q5U5R9	776 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	C3orf62	Q6ZUJ4	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PIWIL4	Q7Z3Z4	852 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	OR1L3	Q8NH93	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SMPDL3A	Q92484	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SEC14L1	Q92503	715 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	VPS39	Q96JC1	886 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PKP4	Q99569	1192 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	CPNE1	Q99829	537 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	LHX9	Q9NQ69	397 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PLCL2	Q9UPR0	1127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	VWA7	Q9Y334	891 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG4-205	ENST00000507692	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692		A0A1W2PPV9	198 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	FAM159B	A6NKW6	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	C21orf140	B9A014	251 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC16A5	O15375	505 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF749	O43361	778 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	KATNA1	O75449	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	SLC16A8	O95907	504 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ITGB2	P05107	769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	WT1	P19544	449 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	TCN2	P20062	427 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	AGXT	P21549	392 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	SAT1	P21673	171 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	CCND1	P24385	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	PSMB5	P28074	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	STX2	P32856	288 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	PHB	P35232	272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	GP5	P40197	560 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	GRIA3	P42263	894 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	AP1S2	P56377	157 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	GPX6	P59796	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	POU4F1	Q01851	419 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	GPS2	Q13227	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG4-205	ENST00000507692	NAB1	Q13506	487 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms