RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 NUP62CLQ9H1M0 184 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 DLL4Q9NR61 685 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TRPC4Q9UBN4 977 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FKBPLQ9UIM3 349 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PLAGL1Q9UM63 463 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 KLHL20Q9Y2M5 609 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 STAB1Q9NY15 2570 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RTTNQ86VV8 2226 aa5.86□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FITM1A5D6W6 292 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ASPDHA6ND91 283 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 C5orf60A6NFR6 353 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 QSOX1O00391 747 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SGTAO43765 313 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CRTAMO95727 393 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 AP2A1O95782 977 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 S1PR4O95977 384 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MBD3O95983 291 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FTH1P02794 183 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RPN2P04844 631 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NFKB1P19838 968 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PTMSP20962 102 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PTPN3P26045 913 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PTGS2P35354 604 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GRIA3P42263 894 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 DYNLT1P63172 113 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 HSF1Q00613 529 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MPP3Q13368 585 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PTPRCAPQ14761 206 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BRD3Q15059 726 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 OR1C1Q15619 314 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SF1Q15637 639 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TAZQ16635 292 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MEP1AQ16819 746 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BTBD16Q32M84 506 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GPR33Q49SQ1 333 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ACER2Q5QJU3 275 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 WASHC2DQ5SRD0 308 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FAM182AQ5T1J6 154 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FIGLAQ6QHK4 219 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TAS2R42Q7RTR8 314 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SNX20Q7Z614 316 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CAMKMTQ7Z624 323 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CD163Q86VB7 1156 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TAX1BP1Q86VP1 789 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RFX6Q8HWS3 928 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 BEST3Q8N1M1 668 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ELMO1Q92556 727 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CABS1Q96KC9 395 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 C18orf12Q96KH6 178 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MRGPRX2Q96LB1 330 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 TEKT5Q96M29 485 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FRMD6Q96NE9 622 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 LCMT1Q9UIC8 334 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 MKL2Q9ULH7 1088 aa5.85□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 COL6A5A8TX70 2615 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PQ72 361 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ZNF487B1APH4 448 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 F8W8V4 182 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 WISP2O76076 250 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PROSCO94903 275 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 AP2A2O94973 939 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 FKBP9O95302 570 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 CYP1A2P05177 515 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 INHBBP09529 407 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 C8orf89P0DMQ9 161 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 SKILP12757 684 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 KDELR1P24390 212 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 ACRV1P26436 265 aa5.84□□□□□ -1.47
CBX1-205ENST00000495350 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms