RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491581.5

HDAC3-211, Transcript of histone deacetylase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC3, Length 777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3-211ENST00000491581 UNC5DQ6UXZ4 953 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GALNT16Q8N428 558 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OR2L3Q8NG85 312 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 COG1Q8WTW3 980 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ASZ1Q8WWH4 475 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SGSM3Q96HU1 749 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 C10orf90Q96M02 699 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC138Q96M89 665 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PKP4Q99569 1192 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SELENOSQ9BQE4 189 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KIFC1Q9BW19 673 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CUTCQ9NTM9 273 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CDC23Q9UJX2 597 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ANAPC5Q9UJX4 755 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 VPS4AQ9UN37 437 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SOX13Q9UN79 622 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.52□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 A0A1B0GX78 115 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HYKKA2RU49 373 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 QSOX1O00391 747 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DSCR3O14972 297 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KIF5CO60282 957 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 JRKO75564 520 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KLHL18O94889 574 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 AGFG2O95081 481 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 S1PR4O95977 384 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KRT14P02533 472 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GSTM1P09488 218 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CHRM3P20309 590 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ITGA3P26006 1051 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TTPAP49638 278 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GSTM4Q03013 218 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GBX1Q14549 363 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SSPNQ14714 243 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF787Q6DD87 383 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CASC4Q6P4E1 433 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 LRRC8BQ6P9F7 803 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 LINC00696Q6ZRV3 163 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MED25Q71SY5 747 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 OVCH1Q7RTY7 1134 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ATCAYQ86WG3 371 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RAB43Q86YS6 212 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DLG3Q92796 817 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NDNQ99608 321 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DPH7Q9BTV6 452 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TSGA10Q9BZW7 698 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SYTL2Q9HCH5 934 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa8.51□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 H0YGG7 62 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 AGPSO00116 658 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MAP3K7O43318 606 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DNAJB6O75190 326 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 HAUS5O94927 633 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MATN4O95460 622 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CLDN1O95832 211 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 B3GALT4O96024 378 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CCDC175P0C221 793 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GP1BBP13224 206 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 TPSB2P20231 275 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 SLC1A2P43004 574 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 GLRBP48167 497 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 NPY2RP49146 381 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CARSP49589 748 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 CLCN7P51798 805 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 KLC1Q07866 573 aa8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
HDAC3-211ENST00000491581 MYBPC3Q14896 1274 aa8.5□□□□□ -1.05
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