RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 COASYQ13057 564 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 RCN2Q14257 317 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FUT11Q495W5 492 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ACCSLQ4AC99 568 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CDK20Q8IZL9 346 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LGI2Q8N0V4 545 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 POC1AQ8NBT0 407 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SPC24Q8NBT2 197 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 UXS1Q8NBZ7 420 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CD101Q93033 1021 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PGM2Q96G03 612 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NSL1Q96IY1 281 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 MARK4Q96L34 752 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PELI2Q9HAT8 420 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FGF21Q9NSA1 209 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FLRT2O43155 660 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ITIH1P19827 911 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.272e-10■■■□□ 18.5
PTPRC-212ENST00000491302 MMD2Q8IY49 270 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 CARNMT1Q8N4J0 409 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 OR13A1Q8NGR1 328 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 GRHL3Q8TE85 626 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FAM20AQ96MK3 541 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 MTMR12Q9C0I1 747 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FAM118AQ9NWS6 357 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 XPNPEP2O43895 674 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PLGP00747 810 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NR3C1P04150 777 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB4P28070 264 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 KCNJ1P48048 391 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 VAMP7P51809 220 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 UBXN1Q04323 297 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 SPDYCQ5MJ68 293 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 NFE4Q86UQ8 179 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 P2RX5Q93086 422 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF350Q9GZX5 532 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 A4GALTQ9NPC4 353 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRC-212ENST00000491302 C2orf81A6NN90 581 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SMTNL1A8MU46 457 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ST8SIA3O43173 380 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LBPP18428 481 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CDH3P22223 829 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SULT2A1Q06520 285 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 RBBP7Q16576 425 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 OR4A47Q6IF82 309 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DNAJC22Q8N4W6 341 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PIGBQ92521 554 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LAT2Q9GZY6 243 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PKD2L2Q9NZM6 624 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 KBTBD13C9JR72 458 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PRAF2O60831 178 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 GH1P01241 217 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PLA2G2AP14555 144 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CA4P22748 312 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 NPBWR1P48145 328 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 MAZP56270 477 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 CACNG1Q06432 222 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 TEFQ10587 303 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R5CQ13362 524 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.07□□□□□ -1.28
PTPRC-212ENST00000491302 DCAF10Q5QP82 559 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms