RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	TET3	O43151	1660 aa		3.15	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.9
SUCLG1-208	ENST00000491123	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A1W2PQ72	361 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	T	O15178	435 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GLRA3	O75311	464 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	THY1	P04216	161 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NMBR	P28336	390 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF79	Q15937	498 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	C2orf83	Q53S99	150 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM139	Q8IV31	216 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERBIN	Q96RT1	1412 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SYNM	O15061	1565 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ERVK-7	P63135	1459 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PIK3C2B	O00750	1634 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NAIP	Q13075	1403 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPAT	Q14207	1427 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDHA2	P29803	388 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	EID3	Q8N140	333 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	WDFY2	Q96P53	400 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PNMA2	Q9UL42	364 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PZP	P20742	1482 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TNR	Q92752	1358 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	STRC	Q7RTU9	1775 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CREB3	O43889	395 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CNTF	P26441	200 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PBX3	P40426	434 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GALC	P54803	685 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR52N5	Q8NH56	324 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	DACH2	Q96NX9	599 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDF	Q9HBH1	243 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUP155	O75694	1391 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ROCK1	Q13464	1354 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	KANK1	Q14678	1352 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLTCL1	P53675	1640 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GH2	P01242	217 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PDX1	P52945	283 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	XG	P55808	180 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRPC3	Q13507	836 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADGRB3	O60242	1522 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	3.12	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	HFM1	A2PYH4	1435 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	DDHD2	O94830	711 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	POLB	P06746	335 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	GCNT1	Q02742	428 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SUCLG1-208	ENST00000491123	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms