RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 SEC16AO15027 2179 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 A0A096LPK6 155 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 A8MU76 341 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ISM1B1AKI9 464 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 H3BMH7 237 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 KLHL2O95198 593 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 SHBGP04278 402 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 COL6A2P12110 1019 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 HIST1H2ADP20671 130 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 HNMTP50135 292 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 TBPL1P62380 186 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ACY1Q03154 408 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 RELAQ04206 551 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ZIC1Q15915 447 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 LGSNQ5TDP6 509 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ISCA2Q86U28 154 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 LCA5Q86VQ0 697 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 PDPRQ8NCN5 879 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ZUFSPQ96AP4 578 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 TCTN2Q96GX1 697 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ATOH8Q96SQ7 321 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 HIST1H2AJQ99878 128 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC77Q9BR77 488 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 H2AFJQ9BTM1 129 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 PCBD2Q9H0N5 130 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 NMRAL1Q9HBL8 299 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 PISDQ9UG56 409 aa15.96■□□□□ 0.15
HCLS1-208ENST00000487290 DSPP15924 2871 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 OR2A25A4D2G3 310 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM49D1C9J1S8 452 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 KERAO60938 352 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 RFPL1O75677 317 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TNFSF15O95150 251 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CCNDBP1O95273 360 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 C1QTNF9P0C862 333 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 FOLR1P15328 257 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 PSMB5P28074 263 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TYK2P29597 1187 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 GGT5P36269 586 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 SLC6A12P48065 614 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 SEPHS1P49903 392 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 SH3BP2P78314 561 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ABATP80404 500 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CSHL1Q14406 222 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TGFBIQ15582 683 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 OR4D1Q15615 310 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF425Q6IV72 752 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 RAPH1Q70E73 1250 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TRIM73Q86UV7 250 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 SYTL1Q8IYJ3 562 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 RHBDF1Q96CC6 855 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CABS1Q96KC9 395 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF285Q96NJ3 590 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 PDE7BQ9NP56 450 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ARL15Q9NXU5 204 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.95■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CDH16O75309 829 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 SYF2O95926 243 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ANXA5P08758 320 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 EBLN1P0CF75 366 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 PVRP15151 417 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 MAGP20916 626 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 HRH2P25021 359 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 GRIA3P42263 894 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 IRF9Q00978 393 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 CYP4F3Q08477 520 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ACAP2Q15057 778 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 FAM83EQ2M2I3 478 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 ICE2Q659A1 982 aa15.94■□□□□ 0.14
HCLS1-208ENST00000487290 FCRL6Q6DN72 434 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms