RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 PXDC1Q5TGL8 231 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA19Q7Z5L4 167 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.82■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 M0R129 80 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SVOPLQ8N434 492 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 FLCNQ8NFG4 579 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GRPEL2Q8TAA5 225 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 STAG3L4Q8TBR4 150 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 KCNC2Q96PR1 638 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 DPY30Q9C005 99 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PCM1Q15154 2024 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC182A6NF36 153 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TLL1O43897 1013 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GGT1P19440 569 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 AQP1P29972 269 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 HTR6P50406 440 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SMARCB1Q12824 385 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CACHD1Q5VU97 1274 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PNCKQ6P2M8 343 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 KDELC1Q6UW63 502 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CILP2Q8IUL8 1156 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 OR2T11Q8NH01 316 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 YIPF6Q96EC8 236 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SNX18Q96RF0 628 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ABCB9Q9NP78 766 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 IKZF3Q9UKT9 509 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 METTL15A6NJ78 407 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 AREL1O15033 823 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GPR39O43194 453 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ADAMTS4O75173 837 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 KRT20P35900 424 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ERVK-8P63133 956 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 MANEALQ5VSG8 457 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 LACC1Q8IV20 430 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 GTF2H4Q92759 462 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PMEPA1Q969W9 287 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM62Q9BVG3 475 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PRKD2Q9BZL6 878 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 HSPB11Q9Y547 144 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TSC2P49815 1807 aa15.81■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TSPAN4O14817 238 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CD1DP15813 335 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CA5AP35218 305 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF45Q02386 682 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 MBTPS1Q14703 1052 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PON2Q15165 354 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF583Q96ND8 569 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ASB2Q96Q27 587 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CNPPD1Q9BV87 410 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SMPD4Q9NXE4 827 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TLR6Q9Y2C9 796 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 MEIOCA2RUB1 952 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ECI2O75521 394 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 LRATO95237 230 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CKBP12277 381 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 POU1F1P28069 291 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35A2P78381 396 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 HMGCS1Q01581 520 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 LINGO4Q6UY18 593 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 IKZF5Q9H5V7 419 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R16Q9NYV7 291 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF639Q9UID6 485 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 OGDHLQ9ULD0 1010 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CBX4O00257 560 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SCO2O43819 266 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 TLR5O60602 858 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFS3O75489 264 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CREG1O75629 220 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 PTGS2P35354 604 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 FAM189BP81408 668 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 CREMQ03060 361 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 DSC3Q14574 896 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 STARD3Q14849 445 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15.8■□□□□ 0.12
CCSAP-204ENST00000483092 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.7 ms