RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 UNC50Q53HI1 259 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO48Q5FWF7 155 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 STPG1Q5TH74 334 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GUSBP11Q6P575 273 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SUSD1Q6UWL2 747 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMD7Q6ZUT3 714 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ASCL5Q7RTU5 278 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf64Q86WR6 236 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 HOMEZQ8IX15 550 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX9Q8N6V9 391 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SNX31Q8N9S9 440 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC01555Q8NAE3 123 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PPFIBP2Q8ND30 876 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC8CQ8TDW0 803 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ESAMQ96AP7 390 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PYCR2Q96C36 320 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC12Q96GR4 267 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEB18Q96M61 343 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB33BQ9H082 229 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PCTPQ9UKL6 214 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A14Q9Y267 594 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 U3KQA8 63 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PPV9 198 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 BTN3A3O00478 584 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TNFSF14O43557 240 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GDF9O60383 454 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OTCP00480 354 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MYF5P13349 255 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 NPPBP16860 134 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TYRP1P17643 537 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GNAZP19086 355 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ACP1P24666 158 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CMPK1P30085 196 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPZBP47756 277 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1D5P58170 312 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PCDH1Q08174 1060 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LCP2Q13094 533 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SQSTM1Q13501 440 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RCN2Q14257 317 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SF1Q15637 639 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 RBBP7Q16576 425 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRED1Q7Z699 444 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PLXDC1Q8IUK5 500 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 KIRREL3Q8IZU9 778 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6Y1Q8NGX8 325 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR48Q8TAF3 677 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 IFI44Q8TCB0 444 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 NCSTNQ92542 709 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PHOX2BQ99453 314 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CD180Q99467 661 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TWSG1Q9GZX9 223 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 DRC3Q9H069 523 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMYND15Q9H091 742 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 GSTO2Q9H4Y5 243 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 IPPKQ9H8X2 491 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCF3Q9NUQ8 709 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 THAP1Q9NVV9 213 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 SPHK1Q9NYA1 384 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 OGFRQ9NZT2 677 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 TAC3Q9UHF0 121 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB1Q9Y576 335 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 WDFY4Q6ZS81 3184 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
SH3BP4-208ENST00000462602 B4GAT1O43505 415 aa9.06□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms