RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 INPP5DQ92835 1189 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC39Q96DD0 335 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC45A3Q96JT2 553 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MIPEPQ99797 713 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ACAT2Q9BWD1 397 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TSSK1BQ9BXA7 367 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CHST8Q9H2A9 424 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE7BQ9NP56 450 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 STARD5Q9NSY2 213 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 KLHL42Q9P2K6 505 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PDE10AQ9Y233 779 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.74□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 E7ENX8 843 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 F8W8V4 182 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 MATN2O00339 956 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 KATNA1O75449 491 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC16A8O95907 504 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATP1A2P50993 1020 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PNLIPRP1P54315 467 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R39P59534 338 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TAP2Q03519 686 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 DNASE1L3Q13609 305 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 PHKG1Q16816 387 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PTCHD3Q3KNS1 767 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf189Q5VU69 101 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 C16orf46Q6P387 395 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ESX1Q8N693 406 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF480Q8WV37 535 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 SEC14L1Q92503 715 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.73□□□□□ -1.33
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC22A11Q9NSA0 550 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PADI1Q9ULC6 663 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 VWA7Q9Y334 891 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2A25A4D2G3 310 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 E7EQ34 232 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EM74 188 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 MEN1O00255 615 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 CDC7O00311 574 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 PFDN6O15212 129 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS26AO75436 327 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-206ENST00000461017 STATHP02808 62 aa6.72□□□□□ -1.33
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