RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CD9P21926 228 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HMGCLP35914 325 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HADHAP40939 763 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC19A1P41440 591 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 VPS41P49754 854 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ARFIP2P53365 341 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TUBA1BP68363 451 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HSD11B2P80365 405 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 FOXM1Q08050 763 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 NIPAL4Q0D2K0 466 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTK6Q13882 451 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CHRNA6Q15825 494 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SNAP47Q5SQN1 464 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KAZNQ674X7 775 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC9A4Q6AI14 798 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 C16orf46Q6P387 395 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC2A7Q6PXP3 512 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 IZUMO2Q6UXV1 221 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BBS12Q6ZW61 710 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MED25Q71SY5 747 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TUBA1AQ71U36 451 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CROCCP2Q86T23 111 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LILRB2Q8N423 598 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CLIP3Q96DZ5 547 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RNF157Q96PX1 679 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SMC6Q96SB8 1091 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 OSBPL10Q9BXB5 764 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GPR63Q9BZJ6 419 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 OR2AG1Q9H205 316 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KCNK9Q9NPC2 374 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GRHL1Q9NZI5 618 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TLK1Q9UKI8 766 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CDC14CA4D256 554 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PRSS47A8MTI9 375 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 APOL1O14791 398 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SNX2O60749 519 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 IPO13O94829 963 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 EML2O95834 649 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PRKAR1AP10644 381 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BTF3P20290 206 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CDKN2BP42772 138 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MAPK9P45984 424 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ARL4DP49703 201 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC8BQ6P9F7 803 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MFSD7Q6UXD7 560 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 C4orf22Q6V702 233 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 AMZ2Q86W34 360 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 OOSP2Q86WS3 158 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TP53INP2Q8IXH6 220 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SLC34A3Q8N130 599 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DDHD1Q8NEL9 900 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SSC4DQ8WTU2 575 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CT55Q8WUE5 264 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CPT1BQ92523 772 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SNF8Q96H20 258 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TGM7Q96PF1 710 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CTRCQ99895 268 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HEMGNQ9BXL5 484 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PITPNM3Q9BZ71 974 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 DTLQ9NZJ0 730 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 WHRNQ9P202 907 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF148Q9UQR1 794 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTPN13Q12923 2485 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MAST4O15021 2626 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PIPSLA2A3N6 862 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 SERPINB7O75635 380 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CDK14O94921 469 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GSTT2P0CG29 244 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 GSTT2BP0CG30 244 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 HLA-DPA1P20036 260 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 MPSTP25325 297 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 PTGIRP43119 386 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RASSF2P50749 326 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CLCN2P51788 898 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BPIFB3P59826 476 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 TUBB3Q13509 450 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 BCL7AQ4VC05 210 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 ARMC6Q6NXE6 501 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 AADACL2Q6P093 401 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RFLNAQ6ZTI6 216 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 CPNE8Q86YQ8 564 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRR-204ENST00000440835 RAB43Q86YS6 212 aa5.84□□□□□ -1.47
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