RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNC2P02585 160 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC2LP0C7M8 214 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 LBPP18428 481 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARL4AP40617 200 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEA11P43364 429 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EFNA5P52803 228 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 UFM1P61960 85 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3BP2P78314 561 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 STXBP2Q15833 593 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TIGD6Q17RP2 521 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 AAK1Q2M2I8 961 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 IGSF11Q5DX21 431 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSKQ6UWY0 536 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 PHC2Q8IXK0 858 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SETD9Q8NE22 299 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLQ8NG68 377 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.2□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 SHROOM3Q8TF72 1996 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 NRCAMQ92823 1304 aa8.2□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PATJQ8NI35 1801 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PQ09 198 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B17O75795 530 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 RPS5P46782 204 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP3CCP48454 512 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PRIM2P49643 509 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CPT1AP50416 773 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 UGT2B15P54855 530 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SP2Q02086 613 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 EMX2Q04743 252 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC9B2Q86UD5 537 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 SVOPLQ8N434 492 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CPA6Q8N4T0 437 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf29Q8N999 325 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 HERVK_113Q902F9 699 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 SLC47A1Q96FL8 570 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 TBATAQ96M53 351 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 ACTR8Q9H981 624 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 MCCC2Q9HCC0 563 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARFIP1P53367 373 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 UGP2Q16851 508 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa8.19□□□□□ -1.1
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD13Q8WZ19 329 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 16.6
RABGEF1-203ENST00000439720 COQ8BQ96D53 544 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CMTM3Q96MX0 182 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 VAT1Q99536 393 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-203ENST00000439720 CRB3Q9BUF7 120 aa8.19□□□□□ -1.1
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