RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PMEPA1Q969W9 287 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 C12orf66Q96MD2 445 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FCRL5Q96RD9 977 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CGREF1Q99674 301 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DMAC2Q9NW81 257 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RIMKLBQ9ULI2 386 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAU2Q9Y6X3 613 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PDLIM1O00151 329 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TSPAN1O60635 241 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 UBXN7O94888 489 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNA7P01567 189 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPDH1P20839 514 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA12P43365 314 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 KHKP50053 298 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CLCNKBP51801 687 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HMGCS1Q01581 520 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 C4orf46Q504U0 113 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PLPP4Q5VZY2 271 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TCEAL6Q6IPX3 200 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PAQR3Q6TCH7 311 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZDHHC24Q6UX98 284 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PAMR1Q6UXH9 720 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LBX2Q6XYB7 198 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GALNT7Q86SF2 657 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC107Q8WV48 283 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 STON2Q8WXE9 905 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 EFCAB11Q9BUY7 163 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HIPK3Q9H422 1215 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TLE6Q9H808 572 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FLRT1Q9NZU1 646 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLX4Q8IY92 1834 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PLOD2O00469 737 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TREHO43280 583 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PRMT3O60678 531 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CHRNB2P17787 502 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MAGEA2P43356 314 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FLT3LGP49771 235 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PDX1P52945 283 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 HERVK_113P63132 956 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR2L8Q8NGY9 312 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC58Q96CX6 371 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FAXDC2Q96IV6 333 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ERVK-6Q9BXR3 956 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA7Q9P0W8 599 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SNX10Q9Y5X0 201 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CPQQ9Y646 472 aa10.76□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 YES1P07947 543 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CLUP10909 449 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PGAM2P15259 253 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PRKCHP24723 683 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 DPYSL2Q16555 572 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GPR33Q49SQ1 333 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf189Q5VU69 101 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 FUT10Q6P4F1 479 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CPA6Q8N4T0 437 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OXSMQ9NWU1 459 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP50Q9UKX7 468 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 RIPK3Q9Y572 518 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN9AQ15858 1988 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6C70A6NIJ9 312 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PPEF2O14830 753 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF208O43345 1280 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA10O75578 1167 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ALPPP05187 535 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 MMP3P08254 477 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 UNGP13051 313 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3CBP42338 1070 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 XKP51811 444 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 CDH15P55291 814 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SP140Q13342 867 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 GFOD2Q3B7J2 385 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 ASB18Q6ZVZ8 466 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM17Q86X19 198 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC30A8Q8IWU4 369 aa10.75□□□□□ -0.69
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC22A15Q8IZD6 547 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms