RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 C4orf19Q8IY42 314 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EMC7Q9NPA0 242 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MEMO1Q9Y316 297 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PIP5K1BO14986 540 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM63AO94886 807 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FPR1P21462 350 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZP3P21754 424 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LTKP29376 864 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FNTBP49356 437 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BAMBIQ13145 260 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CEACAM7Q14002 265 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SV2CQ496J9 727 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 VWA7Q9Y334 891 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CPNE6O95741 557 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RAB36O95755 333 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 EPB42P16452 691 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ETV5P41161 510 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CTBP1Q13363 440 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MSS51Q4VC12 460 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CYBRD1Q53TN4 286 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FAM131BQ86XD5 332 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CEP97Q8IW35 865 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DUSP16Q9BY84 665 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GH2P01242 217 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DPB1P04440 258 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ADRB1P08588 477 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TTPAP49638 278 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CDK5R2Q13319 367 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FTMTQ8N4E7 242 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FNDC11Q9BVV2 318 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RAD18Q9NS91 495 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ITGAMP11215 1152 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DMAP28067 261 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 GDF10P55107 478 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 BCL7AQ4VC05 210 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF691Q5VV52 312 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MARK1Q9P0L2 795 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NLKQ9UBE8 527 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CKAP5Q14008 2032 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 VNN2O95498 520 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MS4A2Q01362 244 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 PIGFQ07326 219 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 MADCAM1Q13477 382 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 DCST1Q5T197 706 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 HACD4Q5VWC8 232 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TXNL1O43396 289 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ADAM8P78325 824 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZMYND11Q15326 602 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 KLHL36Q8N4N3 616 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ST8SIA2Q92186 375 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TTC9Q92623 222 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SBNO1-202ENST00000420886 TCF7L1Q9HCS4 588 aa6.32□□□□□ -1.4
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