RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 DNAJC22Q8N4W6 341 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ABHD8Q96I13 439 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC29A3Q9BZD2 475 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RUBCNLQ9H714 662 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF226Q9NYT6 803 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH2Q9P0N8 246 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 REV1Q9UBZ9 1251 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS51Q9UID3 782 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SHISA3A0PJX4 238 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AGAP5A6NIR3 686 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BTN3A1O00481 513 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AP3D1O14617 1153 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KMOO15229 486 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FFAR2O15552 330 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALT2O60909 372 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NTRK1P04629 796 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B10P36537 528 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HTR3AP46098 478 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NR1D2Q14995 579 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPREQ86SM8 312 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TM9SF4Q92544 642 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP5KQ9BT40 448 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SIAEQ9HAT2 523 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C1GALT1Q9NS00 363 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF4Q9P032 175 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF711Q9Y462 761 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 V9GYH0 126 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINT1O43278 529 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RFPL2O75678 378 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 POMCP01189 267 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RCVRNP35243 200 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NFATC2Q13469 925 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCL15Q16663 113 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PROSER1Q86XN7 944 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8J2Q8NGG1 315 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC38A4Q969I6 547 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP11Q96EK4 314 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf80Q9BSJ5 609 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NOX1Q9Y5S8 564 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ERQ8 282 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 INSIG1O15503 277 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FTH1P02794 183 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR50Q13585 617 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPSAP1Q14558 356 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC26Q2I0M4 334 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf69Q8N8R5 385 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAIQ8N9R8 606 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR26Q8NDV2 337 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC2Q96KP1 924 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CIPCQ9C0C6 399 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HHATLQ9HCP6 504 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PITPNM1O00562 1244 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KDELR3O43731 214 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TLR5O60602 858 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ABLIM3O94929 683 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTHP01270 115 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CDH3P22223 829 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR7P32248 378 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3CBP42338 1070 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC66Q68CR7 880 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 USP43Q70EL4 1123 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ8BQ96D53 544 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR34Q96EX3 536 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP295NLQ96MC4 621 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PARVBQ9HBI1 364 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT52Q9Y366 437 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CFAP54Q96N23 3096 aa3.52□□□□□ -1.85
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