RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 L3MBTL4Q8NA19 623 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FNDC5Q8NAU1 212 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 OR56A3Q8NH54 315 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 HMGB4Q8WW32 186 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 RAD51AP1Q96B01 352 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PYCR2Q96C36 320 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 LGR4Q9BXB1 951 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 OR52A5Q9H2C5 316 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 AIG1Q9NVV5 245 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FBXL21Q9UKT6 434 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ASF1AQ9Y294 204 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 RNF11Q9Y3C5 154 aa6.44□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.44□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SHISA7A6NL88 538 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 PI15O43692 258 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 KDM1AO60341 852 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF217O75362 1048 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC22A3O75751 556 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 APBB3O95704 486 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA4FO95754 770 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC16A8O95907 504 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CEACAM5P06731 702 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 PRR35P0CG20 571 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 ACP5P13686 325 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC2A4P14672 509 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 JUPP14923 745 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GNAZP19086 355 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 IDSP22304 550 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GPX3P22352 226 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CCND1P24385 295 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ACADLP28330 430 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 MAPK1P28482 360 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 IMPA1P29218 277 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ACSL1P33121 698 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CPOXP36551 454 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 HNF4AP41235 474 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GNPDA1P46926 289 aa6.43□□□□□ -1.38
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HDAC8-211ENST00000415409 NUDT2P50583 147 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CCR5P51681 352 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 RAP1GDS1P52306 607 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PFN3P60673 137 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SLC25A3Q00325 362 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PCDH1Q08174 1060 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CHIT1Q13231 466 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PTK2BQ14289 1009 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 KRT33BQ14525 404 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 NFATC4Q14934 902 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SNCBQ16143 134 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 AP5B1Q2VPB7 878 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CCSMST1Q4G0I0 132 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SGO1Q5FBB7 561 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 XKR6Q5GH73 641 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PAOXQ6QHF9 649 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 GK5Q6ZS86 529 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 Q6ZSR9 355 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 DEFB107AQ8IZN7 70 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 SFRP1Q8N474 314 aa6.43□□□□□ -1.38
HDAC8-211ENST00000415409 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa6.43□□□□□ -1.38
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