RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FRMPD2BQ6IN97 320 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GALNT16Q8N428 558 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 IP6K3Q96PC2 410 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ACAT2Q9BWD1 397 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 HOMER3Q9NSC5 361 aa14.89□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.89□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 E5RI56 91 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PFDN6O15212 129 aa14.88□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 MYBPC3Q14896 1274 aa14.88□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 PNPLA2Q96AD5 504 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FKBP10Q96AY3 582 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SAMD15Q9P1V8 674 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MRFAP1Q9Y605 127 aa14.88□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CTAGE9A4FU28 777 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 H3BMM5 538 aa14.87□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 HPS6Q86YV9 775 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PRSS58Q8IYP2 241 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OR4N4Q8N0Y3 316 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZUFSPQ96AP4 578 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 C19orf60Q96EN9 201 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SPSB2Q99619 263 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SLC30A3Q99726 388 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 USP1O94782 785 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 MATN4O95460 622 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 IGHEP01854 428 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ATP5DP30049 168 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CMPK1P30085 196 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 MAGEA6P43360 314 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 CTBP1Q13363 440 aa14.86□□□□□ -0.03
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ACTB-202ENST00000414620 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 RNF44Q7L0R7 432 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ZNF285Q96NJ3 590 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 SERPINB12Q96P63 405 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 TCF12Q99081 682 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 DPH7Q9BTV6 452 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-202ENST00000414620 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.86□□□□□ -0.03
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