RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHBP35232 272 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GP5P40197 560 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNLIPRP1P54315 467 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC12A2P55011 1212 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RPS15P62841 145 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CUL1Q13616 776 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNAB1Q14722 419 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGIF1Q15583 401 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR19Q15760 415 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP40Q5TG30 622 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HECTD2Q5U5R9 776 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RHBDD2Q6NTF9 364 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STRA8Q7Z7C7 330 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPNE9Q8IYJ1 553 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UNC5BQ8IZJ1 945 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPATCH11Q8N954 259 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2L3Q8NG85 312 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STARD8Q92502 1023 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF592Q92610 1267 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IP6K3Q96PC2 410 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADNPQ9H2P0 1102 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPHK1Q9NYA1 384 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PADI2Q9Y2J8 665 aa8.25□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2A25A4D2G3 310 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FITM1A5D6W6 292 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM159BA6NKW6 160 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 E7ENX8 843 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGRPO00253 132 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC16A8O95907 504 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGHEP01854 428 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EZRP15311 586 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCN2P20062 427 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MCM3P25205 808 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GABRB3P28472 473 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPRP35270 261 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RORAP35398 523 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLSTP36957 453 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC26A3P40879 764 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRIA3P42263 894 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEA4P43358 317 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GABRA4P48169 554 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HNMTP50135 292 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKL1Q00532 357 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TAP2Q03519 686 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC20Q12834 499 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNASE1L3Q13609 305 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRM7Q14831 915 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM214AQ32MH5 1076 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRTP1Q5TC63 336 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FIGLAQ6QHK4 219 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYHR1Q6ZMK1 362 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF44Q7L0R7 432 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYVN1Q86TM6 617 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VASH2Q86V25 355 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DSELQ8IZU8 1212 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR1L3Q8NH93 324 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF480Q8WV37 535 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FKBP10Q96AY3 582 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NACC2Q96BF6 587 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM136AQ96C01 138 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLIP3Q96DZ5 547 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THAP11Q96EK4 314 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MVB12AQ96EY5 273 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINGO1Q96FE5 620 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FMO2Q99518 471 aa8.24□□□□□ -1.09
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDNQ99608 321 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms