RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 HAO1Q9UJM8 370 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBXL5Q9UKA1 691 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRHDEQ9UKU6 1024 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA5BQ9Y2D0 317 aa-1.26□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCM1Q15154 2024 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A088AWK7 358 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSD2A1L4K1 749 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf66A4D0T2 115 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YAE9 185 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 K7EQG2 157 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HS3ST1O14792 307 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD28O15084 1053 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERF1AO75920 110 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CER1O95813 267 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERPINC1P01008 464 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KITP10721 976 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CA4P22748 312 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPY1RP25929 384 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDI1P31150 447 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PNLIPRP2P54317 469 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 HMGCS2P54868 508 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 NR1H2P55055 460 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS18P62269 152 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDK18Q07002 472 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DLG2Q15700 870 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 COX19Q49B96 90 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB6CQ53S08 254 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP45Q70EL2 814 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINGO2Q7L985 606 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TTC30AQ86WT1 665 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF677Q86XU0 584 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BEST3Q8N1M1 668 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BEST2Q8NFU1 509 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2L3Q8NG85 312 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR1L3Q8NH93 324 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP4R1Q8TF05 950 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PROX1Q92786 737 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MCRS1Q96EZ8 462 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRAMD2BQ96HH9 432 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPAG5Q96R06 1193 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIR2DL4Q99706 377 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB6CQ9H0N0 254 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZBP1Q9H171 429 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MOB1AQ9H8S9 216 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACKR4Q9NPB9 350 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARP11Q9NR21 331 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKS1Q9NXB0 559 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLAC8Q9NZF1 115 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF212Q9UDV6 495 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CR1P17927 2039 aa-1.27□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CACNA1CQ13936 2221 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM202A6NGA9 273 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TEX22C9J3V5 150 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A26D6RGX4 464 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRM8O00222 908 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYN3O14994 580 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RRP8O43159 456 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 XPOTO43592 962 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR6A2O95222 327 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BMP10O95393 424 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ASMTLO95671 621 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLYCDO95822 493 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MMP1P03956 469 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CYP4B1P13584 511 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYOGP15173 224 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PGAM2P15259 253 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 PKLRP30613 574 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS6KA3P51812 740 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCAN1P53805 252 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPS16P62249 146 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL15RAQ13261 267 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 BIRC3Q13489 604 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDH18Q13634 790 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 RUNX2Q13950 521 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNIP1Q15025 636 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 KYAT1Q16773 422 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPATA46Q5T0L3 261 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF684Q5T5D7 378 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYDE2Q5VT97 1194 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHEQ5VZ18 495 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DENND1BQ6P3S1 775 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa-1.28□□□□□ -2.61
RNU6-172P-201ENST00000411000 CORO6Q6QEF8 472 aa-1.28□□□□□ -2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms