RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SLC26A3P40879 764 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RAB10P61026 200 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PRAMEP78395 509 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZXDBP98169 803 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SEMG2Q02383 582 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HHEXQ03014 270 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SULT2A1Q06520 285 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC20A2Q08357 652 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GRM3Q14832 879 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CYTH1Q15438 398 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TYSND1Q2T9J0 566 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHG6Q3KR16 790 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMEM177Q53S58 311 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NEPROQ6NW34 567 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CES3Q6UWW8 571 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C11orf74Q86VG3 221 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A41Q8N5S1 370 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HIPK4Q8NE63 616 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GPR150Q8NGU9 434 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BRSK1Q8TDC3 778 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STYXQ8WUJ0 223 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ALG14Q96F25 216 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 AGAP2Q99490 1192 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FOXB1Q99853 325 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PITPNM3Q9BZ71 974 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 EBF3Q9H4W6 596 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FAM96AQ9H5X1 160 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IL21RQ9HBE5 538 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 POPDC3Q9HBV1 291 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NOD2Q9HC29 1040 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ABCB8Q9NUT2 735 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TDP1Q9NUW8 608 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC17A7Q9P2U7 560 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.45□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 A0A096LPK6 155 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 H7C0S8 307 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PFDN6O15212 129 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SNAP91O60641 907 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PLIN3O60664 434 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 DCTN3O75935 186 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PGLSO95336 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CD160O95971 181 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 BPGMP07738 259 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 JMJD7P0C870 316 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STMN1P16949 149 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IL12RB1P42701 662 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RGRP47804 291 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SCNN1BP51168 640 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 STC1P52823 247 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PRKAA2P54646 552 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ADAM8P78325 824 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 MPP1Q00013 466 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TRAF2Q12933 501 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SLC14A1Q13336 389 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RUNX3Q13761 415 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GALNT3Q14435 633 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CNGA3Q16281 694 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FUT11Q495W5 492 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FSCBQ5H9T9 825 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PITRM1Q5JRX3 1037 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CGB2Q6NT52 195 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C22orf39Q6P5X5 142 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C6orf89Q6UWU4 347 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SRLQ86TD4 932 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SFTPA1Q8IWL2 248 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 AHI1Q8N157 1196 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OTUD6BQ8N6M0 293 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.44□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms