RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 SEC13P55735 322 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 UGT8Q16880 541 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FUT10Q6P4F1 479 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 WACQ9BTA9 647 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC106Q9BWC9 280 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 FZD8Q9H461 694 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GKN1Q9NS71 199 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PLOD2O00469 737 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 KLF11O14901 512 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TYROBPO43914 113 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 IGFBP4P22692 258 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PGDP52209 483 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 PRR5P85299 388 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SP2Q02086 613 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF311Q5JNZ3 666 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MGME1Q9BQP7 344 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.9□□□□□ -0.02
PTGFRN-201ENST00000393203 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HTR7P34969 479 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MINDY4Q4G0A6 757 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C4orf46Q504U0 113 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRR23BQ6ZRT6 265 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CNIH3Q8TBE1 160 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF39Q9H2S5 420 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLIT3O75094 1523 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HAS3O00219 553 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SNAP29O95721 258 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 IDSP22304 550 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 IGFALSP35858 605 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FLT3LGP49771 235 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ARHGDIBP52566 201 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC18A1P54219 525 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC3A1Q07837 685 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TLR1Q15399 786 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ARL9Q6T311 187 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RIPOR3Q96MK2 946 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ACTR3BQ9P1U1 418 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LOC730098B7Z3J9 87 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PRLP01236 227 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KLK1P06870 262 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 AGTR2P50052 363 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SNX29P2Q8IUI4 249 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RASSF5Q8WWW0 418 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 EHD1Q9H4M9 534 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 BRD7Q9NPI1 651 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 I3L521 148 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ANXA8P13928 327 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GNAZP19086 355 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 NXPE1Q8N323 547 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 AQP11Q8NBQ7 271 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SETD6Q8TBK2 473 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HAVCR1Q96D42 359 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC6A15Q9H2J7 730 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 TIGARQ9NQ88 270 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CFL2Q9Y281 166 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 IRAK2O43187 625 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MSCO60682 206 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ALPPP05187 535 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C8BP07358 591 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB39AQ14964 217 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2L3Q8NG85 312 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MARK1Q9P0L2 795 aa14.89□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MLLT10P55197 1068 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 ANKDD1AQ495B1 522 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 GALNT12Q8IXK2 581 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LNX2Q8N448 690 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 DTX3Q8N9I9 347 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C17orf50Q8WW18 174 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 MUS81Q96NY9 551 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 VPS29Q9UBQ0 182 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.88□□□□□ -0.03
PTGFRN-201ENST00000393203 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms