RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368507.7

ROS1-201, Transcript of ROS proto-oncogene 1, receptor tyrosine kinase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ROS1, Length 7,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROS1-201ENST00000368507 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 ZNF627Q7L945 461 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 ZNF540Q8NDQ6 660 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 KCTD13Q8WZ19 329 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 SLC38A4Q969I6 547 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 DEFB126Q9BYW3 111 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 Q9N2J8 555 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 FAIMQ9NVQ4 179 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 ING4Q9UNL4 249 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 DUXAA6NLW8 204 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 AZIN1O14977 448 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 OR3A2P47893 321 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 FNDC8Q8TC99 324 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 PDZD7Q9H5P4 517 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 TCF7L1Q9HCS4 588 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 RAB9BQ9NP90 201 aa5□□□□□ -1.61
ROS1-201ENST00000368507 BRD7Q9NPI1 651 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 C3orf18Q9UK00 162 aa5□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 PREPP48147 710 aa4.99□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 MED22Q15528 200 aa4.99□□□□□ -1.61
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ROS1-201ENST00000368507 LAPTM4BQ86VI4 370 aa4.99□□□□□ -1.61
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