RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 PYGO2Q9BRQ0 406 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 THAP2Q9H0W7 228 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPV4Q9HBA0 871 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHST11Q9NPF2 352 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAN1B1Q9UKM7 699 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPV2Q9Y5S1 764 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM169AQ9Y6X4 670 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPQ1 181 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 C15orf61A6NNL5 157 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPNA7A9QM74 516 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 E9PQ18 207 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP2A7P20853 494 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LHCGRP22888 699 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGER4P35408 488 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR10P46092 362 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 HUNKP57058 714 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMO4P61968 165 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLC1Q07866 573 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRT71Q3SY84 523 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTE1Q5JU00 501 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf163Q5TEZ5 329 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR27Q6MZM9 219 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM198BQ6UWH4 519 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZRP5 223 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRINP3Q76B58 766 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGI2Q8N0V4 545 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYG1Q8N1E2 194 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TC2NQ8N9U0 490 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR6S1Q8NH40 331 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1L3Q8NH93 324 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF519Q8TB69 540 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM222BQ8WU58 562 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIGBQ92521 554 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MOB3AQ96BX8 217 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 C10orf90Q96M02 699 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PKP2Q99959 881 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 WWTR1Q9GZV5 400 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPHK2Q9NRA0 654 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OLAHQ9NV23 265 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANAPC2Q9UJX6 822 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPM1 405 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PR80 420 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM77I1YAP6 450 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ENM7 598 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 O00370 1275 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR2F1P10589 423 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF2P14316 349 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT1A4P22310 534 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCGF2P35227 344 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALDH3A2P51648 485 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCR3P51677 355 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSCP56915 257 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYCSP99999 105 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CUL3Q13618 768 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITGA7Q13683 1181 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NECTIN1Q15223 517 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LETM2Q2VYF4 491 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 C2CD6Q53TS8 623 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR78Q5VTH9 848 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYSMD4Q5XG99 296 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR139Q6DWJ6 353 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP161Q6P656 301 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 POMGNT2Q8NAT1 580 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 POGLUT1Q8NBL1 392 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4K1Q8NGD4 311 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAPK15Q8TD08 544 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 GATAD1Q8WUU5 269 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLCO2A1Q92959 643 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 C4orf45Q96LM5 186 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGFL8Q99944 293 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRRG4Q9BZD6 226 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 MORF4L1Q9UBU8 362 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF150Q9ULK6 438 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR83OSQ9Y284 106 aa2.64□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms