RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ACPTQ9BZG2 426 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KCTD5Q9NXV2 234 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NSG1P42857 185 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 METAP1P53582 386 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NFATC3Q12968 1075 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBA3CQ13748 450 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKL4Q5MAI5 379 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CACUL1Q86Y37 369 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SVOPLQ8N434 492 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJB8Q8NHS0 232 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CLHC1Q8NHS4 586 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF7Q92985 503 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM162AQ96A26 154 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LYSMD1Q96S90 227 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SERHLQ9NQF3 203 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D23Q9NUY8 699 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA5P08758 320 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CRHBPP24387 322 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GZMMP51124 257 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PON2Q15165 354 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MOGQ16653 247 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BROXQ5VW32 411 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 XAF1Q6GPH4 301 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C22orf39Q6P5X5 142 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 XKR5Q6UX68 686 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C12orf40Q86WS4 652 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PHACTR4Q8IZ21 702 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC32A1Q9H598 525 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 FANCEQ9HB96 536 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HPS4Q9NQG7 708 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL42Q9P2K6 505 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ERN1O75460 977 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CREG1O75629 220 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IGSF6O95976 241 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT6AP02538 564 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT6BP04259 564 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT6CP48668 564 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RPIAP49247 311 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPN5P54829 565 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB15P59190 212 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LAPTM5Q13571 262 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CRTC1Q6UUV9 634 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GCNT7Q6ZNI0 430 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HS3ST5Q8IZT8 346 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SCAMP4Q969E2 229 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ITFG2Q969R8 447 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ASIC4Q96FT7 647 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RFXAPO00287 272 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ABCB7O75027 752 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PDYNP01213 254 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CCNA2P20248 432 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CLDN8P56748 225 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RPS14P62263 151 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 EPS8Q12929 822 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 BNIP3Q12983 259 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 TTC23LQ6PF05 361 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 GIPC3Q8TF64 312 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX19Q92543 992 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNH6Q9H252 994 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGIXQ9H6Y5 334 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 SPHK2Q9NRA0 654 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 DENND4CQ5VZ89 1909 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 F5P12259 2224 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A096LPI6 279 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM220BPB1ANY3 271 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 NOBOXO60393 691 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 ADIPOR2Q86V24 386 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf111Q8N326 155 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 CPXM2Q8N436 756 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFLR1Q9H665 355 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE10AQ9Y233 779 aa18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.24■□□□□ 0.51
SH3BP1-201ENST00000357436 IL1RNP18510 177 aa18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms