RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 WDR70Q9NW82 654 aa20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 RARRES3Q9UL19 164 aa20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SSUH2Q9Y2M2 353 aa20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 MGAQ8IWI9 3026 aa20.29■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 TMEM150CB9EJG8 249 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 EFSO43281 561 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 CD82P27701 267 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 PHBP35232 272 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 GRIA3P42263 894 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SP140Q13342 867 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 TCTN2Q96GX1 697 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 POPDC3Q9HBV1 291 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SLC6A20Q9NP91 592 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 ANKRD12Q6UB98 2062 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 NBEAQ8NFP9 2946 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 LOC400499M0QZD8 3231 aa20.28■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 H3BMH7 237 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 RAD1O60671 282 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 NTRK1P04629 796 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 CYP2A7P20853 494 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SLC12A2P55011 1212 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SLMAPQ14BN4 828 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SLC38A9Q8NBW4 561 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 CCDC138Q96M89 665 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 DPH1Q9BZG8 443 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 EPB41L4BQ9H329 900 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 SYTL2Q9HCH5 934 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 TAC3Q9UHF0 121 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 CHD6Q8TD26 2715 aa20.27■□□□□ 0.84
USP45-202ENST00000329966 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CTSVO60911 334 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 MSL3P1P0C860 447 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 STMN1P16949 149 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 WT1P19544 449 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 TSNQ15631 228 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 MROH9Q5TGP6 573 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 AGTRAPQ6RW13 159 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 GALNT6Q8NCL4 622 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SLC44A1Q8WWI5 657 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 TSPAN17Q96FV3 270 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SH2B3Q9UQQ2 575 aa20.27■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 GUCA1CO95843 209 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SLC35E2BP0CK96 405 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CCDC166P0CW27 439 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 HSD17B2P37059 387 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 RAB10P61026 200 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 DLG1Q12959 904 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CPNE5Q9HCH3 593 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 ARL15Q9NXU5 204 aa20.26■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 RIPK2O43353 540 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CSRP3P50461 194 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 PMS2P54278 862 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 TBPL1P62380 186 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 NAE1Q13564 534 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 ICE2Q659A1 982 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 NLGN4XQ8N0W4 816 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 PTERQ96BW5 349 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 UBXN10Q96LJ8 280 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 PAFAH2Q99487 392 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 DPH7Q9BTV6 452 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 DERL2Q9GZP9 239 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 SCRG1O75711 98 aa20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 CD1DP15813 335 aa20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 GCAP28676 217 aa20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 IRF9Q00978 393 aa20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP45-202ENST00000329966 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms