RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 DRD4P21917 467 aa26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF883P0CG24 379 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 UROSP10746 265 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 AMD1P17707 334 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 HMOX2P30519 316 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 NR0B2Q15466 257 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 SF1Q15637 639 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 INAVAQ3KP66 663 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 LETMD1Q6P1Q0 360 aa26.48■■□□□ 1.83
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
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