RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299667.8

ZNF3-202, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF3, Length 2,799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-202ENST00000299667 PDYNP01213 254 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 DNTTP04053 509 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RHOCP08134 193 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 EPB42P16452 691 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GADD45AP24522 165 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PTPN6P29350 595 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GRK3P35626 688 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SEMG2Q02383 582 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 MGAT3Q09327 533 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SPATC1Q76KD6 591 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SERINC5Q86VE9 423 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RNF175Q8N4F7 328 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PAF1Q8N7H5 531 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 DNASE1L2Q92874 299 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 BCL7BQ9BQE9 202 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 NACA2Q9H009 215 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 KCNH6Q9H252 994 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 MARCH7Q9H992 704 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GKN1Q9NS71 199 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 IL37Q9NZH6 218 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 IL17CQ9P0M4 197 aa8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GBF1Q92538 1859 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 OR2A25A4D2G3 310 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 KRT87PA6NCN2 255 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 H3BNC9 293 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GJB5O95377 273 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CD9P21926 228 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CACNG1Q06432 222 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ABHD18Q0P651 414 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 KEAP1Q14145 624 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 DSC3Q14574 896 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PLEKHG6Q3KR16 790 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF404Q494X3 552 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GPR153Q6NV75 609 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 LINC00299Q6ZSB3 139 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 AKAP14Q86UN6 197 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CDC26Q8NHZ8 85 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SLC38A4Q969I6 547 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 TPD52L3Q96J77 140 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 KCNC2Q96PR1 638 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ASB8Q9H765 288 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 IL1RAPQ9NPH3 570 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 QPCTLQ9NXS2 382 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 M0R082 166 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 WNT9AO14904 365 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CCNDBP1O95273 360 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PRAMEF1O95521 474 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 FABP3P05413 133 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 IRF1P10914 325 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 COL6A1P12109 1028 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ENGP17813 658 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ALOX12P18054 663 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GRK5P34947 590 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 MAGEA2P43356 314 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 GJA8P48165 433 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RGS4P49798 205 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 NUDT6P53370 316 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CXCR4P61073 352 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 NPRL3Q12980 569 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 DUSP4Q13115 394 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PRSS48Q7RTY5 328 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 HEATR4Q86WZ0 1026 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 UROC1Q96N76 676 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CTRCQ99895 268 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 EBPLQ9BY08 206 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 OARD1Q9Y530 152 aa8.3□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 AGAP5A6NIR3 686 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 EVPLLA8MZ36 301 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 RFPL2O75678 378 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 KLKB1P03952 638 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 FPR1P21462 350 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 AQP1P29972 269 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 SLC19A1P41440 591 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CLDN8P56748 225 aa8.29□□□□□ -1.08
ZNF3-202ENST00000299667 CYP4F2P78329 520 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms