RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299179.9

MRPL43-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MRPL43, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL43-201ENST00000299179 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ALOX12BO75342 701 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 PAMP19021 973 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 OR1D4P47884 311 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 NKG7Q16617 165 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FCRL6Q6DN72 434 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 C5orf34Q96MH7 638 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CTSFQ9UBX1 484 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MAU2Q9Y6X3 613 aa15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 HYKKA2RU49 373 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 VPS26AO75436 327 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 VAPBO95292 243 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 C1orf105O95561 183 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CHRM3P20309 590 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MGAT1P26572 445 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 PSMB5P28074 263 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 NMBRP28336 390 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CMPK1P30085 196 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CDC25BP30305 580 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FMO4P31512 558 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CARSP49589 748 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 TERF1P54274 439 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SOX8P57073 446 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SARNPP82979 210 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 WASHC2DQ5SRD0 308 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CASC4Q6P4E1 433 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 PARP9Q8IXQ6 854 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 DNAJB14Q8TBM8 379 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 COG1Q8WTW3 980 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FAM136AQ96C01 138 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CABS1Q96KC9 395 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CRB3Q9BUF7 120 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MENTQ9BUN1 341 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SLC22A11Q9NSA0 550 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SPATA7Q9P0W8 599 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SAMD15Q9P1V8 674 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SHANK1Q9Y566 2161 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 NFS1Q9Y697 457 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.47■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MAP2K7O14733 419 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FGGP02679 453 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CDC16Q13042 620 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 GRB7Q14451 532 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 HIF1AQ16665 826 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MUM1Q2TAK8 710 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 OR2L3Q8NG85 312 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 MIEF2Q96C03 454 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SPSB2Q99619 263 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 LHPPQ9H008 270 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 P2RY12Q9H244 342 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 FAM114A2Q9NRY5 505 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 TREX1Q9NSU2 369 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SLC5A6Q9Y289 635 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.46■□□□□ 0.07
MRPL43-201ENST00000299179 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ZNF839A8K0R7 811 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 GOLGA8TH3BQL2 631 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ESR1P03372 595 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ACPPP15309 386 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 PRMT9Q6P2P2 845 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 CES3Q6UWW8 571 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 Q6ZS92 163 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 CUZD1Q86UP6 607 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 MFSD3Q96ES6 412 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 CCDC68Q9H2F9 335 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 HOMER3Q9NSC5 361 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 SYBUQ9NX95 663 aa15.45■□□□□ 0.06
MRPL43-201ENST00000299179 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms