RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297598.4

PDP1-201, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 4,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-201ENST00000297598 LGI4Q8N135 537 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 XAGE5Q8WWM1 108 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ZNF382Q96SR6 550 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 YME1L1Q96TA2 773 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 INPP5KQ9BT40 448 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ITPAQ9BY32 194 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KCTD5Q9NXV2 234 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 MATN4O95460 622 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 STSP08842 583 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CDK5R2Q13319 367 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 MAL2Q969L2 176 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CAMKK2Q96RR4 588 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 DUSP26Q9BV47 211 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 NLNQ9BYT8 704 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CCRL2O00421 344 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 STX16O14662 325 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ELNP15502 786 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 FSHRP23945 695 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SLC15A1P46059 708 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CDH4P55283 916 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 UXS1Q8NBZ7 420 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KAT2AQ92830 837 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TP53INP1Q96A56 240 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PPCDCQ96CD2 204 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TSPAN18Q96SJ8 248 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ATOH8Q96SQ7 321 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 COMMD3Q9UBI1 195 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 BTAF1O14981 1849 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CKMT1AP12532 417 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 GGT1P19440 569 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PIGAP37287 484 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 UBE2FQ969M7 185 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 EGLN2Q96KS0 407 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 UROC1Q96N76 676 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TPT1P8Q9HAU6 139 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ZNF510Q9Y2H8 683 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 EPHB3P54753 998 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 OLR1P78380 273 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SLC25A13Q9UJS0 675 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PEX16Q9Y5Y5 336 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CASKO14936 926 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 C9P02748 559 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 LRG1P02750 347 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 CCL23P55773 120 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KCNA10Q16322 511 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 KRT74Q7RTS7 529 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 STMN3Q9NZ72 180 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 A0A096LPI6 279 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 K7ERQ8 282 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 GJB5O95377 273 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PRPS2P11908 318 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PFKLP17858 780 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 FPR1P21462 350 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 TALDO1P37837 337 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SPAM1P38567 509 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ST3GAL4Q11206 333 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 COL26A1Q96A83 441 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 MAF1Q9H063 256 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 NHSQ6T4R5 1651 aa14.98□□□□□ -0.01
PDP1-201ENST00000297598 SCN1AP35498 2009 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms