RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ACAD11Q709F0 780 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 IPMKQ8NFU5 416 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4K2Q8NGD2 314 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMF1Q92530 271 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ELMO1Q92556 727 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FCRL5Q96RD9 977 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MAU2Q9Y6X3 613 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNA1CQ13936 2221 aa7.5□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NF1P21359 2839 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FITM1A5D6W6 292 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 A8MUI8 341 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC9O14530 226 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR39O43194 453 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF2O75151 1096 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 VPS26AO75436 327 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PROSCO94903 275 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF24P17028 368 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GEMP55040 296 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OLIG2Q13516 323 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKBIBQ15653 356 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CEBPEQ15744 281 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TAZQ16635 292 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 WASHC2DQ5SRD0 308 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PAOXQ6QHF9 649 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 COX15Q7KZN9 410 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PID1Q7Z2X4 250 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 RFX6Q8HWS3 928 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC5A8Q8N695 610 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PQLC3Q8N755 202 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5AR1Q8NGP9 310 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRB4Q8NHJ6 448 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GSDMBQ8TAX9 411 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NUDT8Q8WV74 236 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf44Q96CB5 159 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CABS1Q96KC9 395 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD6Q96KE9 485 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SARGQ9BW04 601 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 THAP2Q9H0W7 228 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ENAMQ9NRM1 1142 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 SPHK1Q9NYA1 384 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 UVRAGQ9P2Y5 699 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC4Q9UBN4 977 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ALG6Q9Y672 507 aa7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 ASPDHA6ND91 283 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 AGAP14A8MT82 685 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 HCRTR1O43613 425 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PRMT3O60678 531 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP1A2P05177 515 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 TPOP07202 933 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFZP0C0S5 128 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 OR56A5P0C7T3 313 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 C8orf89P0DMQ9 161 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 IGFBP2P18065 325 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 NFKB1P19838 968 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 CD9P21926 228 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 MSX1P28360 303 aa7.48□□□□□ -1.21
PGGT1B-201ENST00000296642 PDHA2P29803 388 aa7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms