RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SIX5Q8N196 739 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ITGA3P26006 1051 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 DGKQP52824 942 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 GPR151Q8TDV0 419 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1191Q96A73 305 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SPEF2Q9C093 1822 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 S100A6P06703 90 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FPR1P21462 350 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 KCNA5P22460 613 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 IDNKQ5T6J7 187 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 ABCG4Q9H172 646 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SCML2Q9UQR0 700 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.65■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 J3KR12 359 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NRP1O14786 923 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 SLITRK4Q8IW52 837 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 CLIP4Q8N3C7 705 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 FAM110BQ8TC76 370 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PLEKHO2Q8TD55 490 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 NUS1Q96E22 293 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 TBC1D24Q9ULP9 559 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa20.64■□□□□ 0.9
CCSAP-201ENST00000284617 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PDSS2Q86YH6 399 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DCSTAMPQ9H295 470 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC28A3Q9HAS3 691 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM9Q9P0T7 183 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR14I1A6ND48 311 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ANKRD66B4E2M5 251 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TLR4O00206 839 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 HOXD13P35453 343 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SYT16Q17RD7 645 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PQLC3Q8N755 202 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR2AP1Q8NGE2 309 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 RGMAQ96B86 450 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DPEP2Q9H4A9 486 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 FAM189A1O60320 539 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF823P16415 610 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GNALP38405 381 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA1BP68363 451 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SP2Q02086 613 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CHRNA6Q15825 494 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC2A7Q6PXP3 512 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TUBA1AQ71U36 451 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 STX12Q86Y82 276 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ING5Q8WYH8 240 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALT6Q96L58 329 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP3Q96NJ6 502 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CLCC1Q96S66 551 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MNTQ99583 582 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ITPAQ9BY32 194 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SIRPGQ9P1W8 387 aa20.64■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SERINC3Q13530 473 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR4F6Q8NGB9 312 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CDC7O00311 574 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PPEF2O14830 753 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ACSL1P33121 698 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 MASP1P48740 699 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 STC1P52823 247 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OR2B6P58173 313 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJB13P59910 316 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.63■□□□□ 0.891e-6■□□□□ 8.9
CCSAP-201ENST00000284617 SMYD5Q6GMV2 418 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL6Q8WZ60 621 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 GPR88Q9GZN0 384 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 A0A0U1RQF3 1178 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ATP4BP51164 291 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM8P78325 824 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa20.63■□□□□ 0.89
CCSAP-201ENST00000284617 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms