RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 PEX12O00623 359 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 GRIA2P42262 883 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 PTSQ03393 145 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 FAR1Q8WVX9 515 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 NXNL1Q96CM4 212 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 PTPN18Q99952 460 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 SIX2Q9NPC8 291 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 CTSAP10619 480 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 CPN2P22792 545 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 UGT2B15P54855 530 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 C2orf76Q3KRA6 126 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 BEND5Q7L4P6 421 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ZNF540Q8NDQ6 660 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 DNASE1L2Q92874 299 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 MFSD3Q96ES6 412 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 NDC1Q9BTX1 674 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 HCRTO43612 131 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 OR6B1O95007 311 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 JMJD7P0C870 316 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 CCINQ13939 588 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 ELOCQ15369 112 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 SLCO6A1Q86UG4 719 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 UBR7Q8N806 425 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 DPF1Q92782 380 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 FAM83CQ9BQN1 747 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 OGDHLQ9ULD0 1010 aa10.65□□□□□ -0.7
URB2-201ENST00000258243 CCR8P51685 355 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CDC42P60953 191 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ACTR3P61158 418 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 INCA1Q0VD86 236 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CYP1B1Q16678 543 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 FAM171BQ6P995 826 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CPNE9Q8IYJ1 553 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 BANPQ8N9N5 519 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PIGKQ92643 395 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 TSSK3Q96PN8 268 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MIPEPQ99797 713 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 TMEM59LQ9UK28 342 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 GMPPBQ9Y5P6 360 aa10.65□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 A8MU76 341 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 GMFGO60234 142 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 SLC35G1Q2M3R5 365 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 TMEM27Q9HBJ8 222 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 TMEM248Q9NWD8 314 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 POMPQ9Y244 141 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 WRBO00258 174 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 METTL18O95568 372 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZNF12P17014 697 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 LIMK2P53671 638 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 SLC10A7Q0GE19 358 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PLCZ1Q86YW0 608 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MAGEE1Q9HCI5 957 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 SLC7A8Q9UHI5 535 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 STYXL1Q9Y6J8 313 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MYL9P24844 172 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CAPGP40121 348 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 IDH2P48735 452 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 HADHBP55084 474 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 HKDC1Q2TB90 917 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 KBTBD6Q86V97 674 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 PDPRQ8NCN5 879 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 STOML3Q8TAV4 291 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MAPK15Q8TD08 544 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 MYDGFQ969H8 173 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZNF354BQ96LW1 612 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 TGM5O43548 720 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 NRP2O60462 931 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 GNAZP19086 355 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CCKBRP32239 447 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 GRK5P34947 590 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CLCNKAP51800 687 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 CDKL1Q00532 357 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.64□□□□□ -0.71
URB2-201ENST00000258243 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms