RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 NUAK1O60285 661 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CXCL10P02778 98 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 HTR1AP08908 422 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 AGXTP21549 392 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CDKN2CP42773 168 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MAGEA2P43356 314 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SLC6A12P48065 614 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CCL23P55773 120 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CPZQ66K79 652 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 DOK6Q6PKX4 331 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SERPINA11Q86U17 422 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 BBS7Q8IWZ6 715 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ELMOD1Q8N336 334 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ECHDC3Q96DC8 303 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 APIPQ96GX9 242 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 NODALQ96S42 347 aa15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 BNIP3LO60238 219 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC159P0C7I6 412 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MPC1LP0DKB6 136 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SRCP12931 536 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PFKLP17858 780 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 KIR3DL1P43629 444 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 DPY19L1Q2PZI1 675 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 DEFB128Q7Z7B8 93 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PYCR2Q96C36 320 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHA8Q96JA3 519 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PALMDQ9NP74 551 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 BCKDKO14874 412 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 LRATO95237 230 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 URODP06132 367 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 ITGAMP11215 1152 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 AMD1P17707 334 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CYP2A7P20853 494 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 LHCGRP22888 699 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 BMXP51813 675 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SP140Q13342 867 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 GBX1Q14549 363 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 FRG2Q64ET8 278 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 NEK5Q6P3R8 708 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 C16orf87Q6PH81 154 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 SETD9Q8NE22 299 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 GIPC3Q8TF64 312 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 EGLN2Q96KS0 407 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 APOLD1Q96LR9 279 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 FRG2BQ96QU4 278 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 HHIPQ96QV1 700 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 DGCR6LQ9BY27 220 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 GPRC5BQ9NZH0 403 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.96■□□□□ 0.15
HOXD3-201ENST00000249440 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SERTM1A2A2V5 107 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PTGES3LE9PB15 166 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 SLC16A5O15375 505 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 UGT2B11O75310 529 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CLPXO76031 633 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF682O95780 498 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF12P17014 697 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ITIH1P19827 911 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PRPS1L1P21108 318 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 IGFBP5P24593 272 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 GABRR2P28476 465 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 TRPC1P48995 793 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 STK19P49842 368 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 AP1S2P56377 157 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 OR4F3Q6IEY1 312 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 NOXRED1Q6NXP6 359 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF554Q86TJ5 538 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CHPFQ8IZ52 775 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 PIK3C3Q8NEB9 887 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 MCOLN3Q8TDD5 553 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 NELL1Q92832 810 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 MUL1Q969V5 352 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 ZNF566Q969W8 418 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 VOPP1Q96AW1 172 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 CSF3RQ99062 836 aa15.95■□□□□ 0.14
HOXD3-201ENST00000249440 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms