RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 KDM4DQ6B0I6 523 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SNX20Q7Z614 316 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SLX1AQ9BQ83 275 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ASB8Q9H765 288 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 OR6C75A6NL08 312 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 EPB42P16452 691 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 GRK3P35626 688 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 VLDLRP98155 873 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGEF7Q14155 803 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SMU1Q2TAY7 513 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 PRSS36Q5K4E3 855 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 LYSMD2Q8IV50 215 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 LINC01599Q8WXQ3 324 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ACPTQ9BZG2 426 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 OSGIN1Q9UJX0 560 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 AP3M1Q9Y2T2 418 aa26.34■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 EOMESO95936 686 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 IRF1P10914 325 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ATF6P18850 670 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 DGKAP23743 735 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 LIPAP38571 399 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 CLK1P49759 484 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 GPR17Q13304 367 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 DEPDC1Q5TB30 811 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 CERS6Q6ZMG9 384 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 GALNT13Q8IUC8 556 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 OR6K2Q8NGY2 324 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 EGLN2Q96KS0 407 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 LATS2Q9NRM7 1088 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 A0A096LPI6 279 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 EBLN1P0CF75 366 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 MAGEA2P43356 314 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 NEK2P51955 445 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 CREMQ03060 361 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 LRIF1Q5T3J3 769 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 C6orf183Q5T699 404 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ATAD3BQ5T9A4 648 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 RASAL3Q86YV0 1011 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 POC5Q8NA72 575 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 ATG16L2Q8NAA4 619 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 APOL4Q9BPW4 351 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 NTMT1Q9BV86 223 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 AMBNQ9NP70 447 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 SIRT5Q9NXA8 310 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 KIF17Q9P2E2 1029 aa26.33■■□□□ 1.81
FAM149A-201ENST00000227065 GLTPD2A6NH11 291 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 CYBAP13498 195 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 MTA1Q13330 715 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 KEAP1Q14145 624 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 STEAP3Q658P3 488 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 USP7Q93009 1102 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 ITM2CQ9NQX7 267 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 TRPS1Q9UHF7 1281 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PCDHGA12O60330 932 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 WDR47O94967 919 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 DLGAP3O95886 979 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PDYNP01213 254 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 CTGFP29279 349 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PTPN6P29350 595 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 ARHGDIAP52565 204 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 C17orf99Q6UX52 265 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 SOCS4Q8WXH5 440 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 HCSTQ9UBK5 93 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 LHX3Q9UBR4 397 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PPT2Q9UMR5 302 aa26.32■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 OR2A25A4D2G3 310 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 WBP4O75554 376 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 UPK1BO75841 260 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PGLSO95336 258 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 SPNP16150 400 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 IL1RNP18510 177 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 SVOPQ8N4V2 548 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 ZBTB2Q8N680 514 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 WBP2Q969T9 261 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 KRT84Q9NSB2 600 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 ASIC5Q9NY37 505 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1B0GVM2 712 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 PSMD11O00231 422 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 KCNK2O95069 426 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 RBFAQ8N0V3 343 aa26.31■■□□□ 1.8
FAM149A-201ENST00000227065 IL1RAPQ9NPH3 570 aa26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms