RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032487.13

Vamp1-201, Transcript of Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Vamp1, Length 2,772 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nrif1Q923B3 828 aa11.36□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Acer3Q9D099 267 aa11.36□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Plekhb1Q9QYE9 243 aa11.36□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mtmr1Q9Z2C4 669 aa11.36□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa11.36□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc9a6A1L3P4 702 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1123A2AT85 323 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc25a54B1AUS6 473 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pdzd8B9EJ80 1147 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm10722F6VLK5 217 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr731F8VQB9 326 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rundc3aO08576 446 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NfkbieO54910 364 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tpst2O88856 376 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pim1P06803 397 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nr2f6P43136 390 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CartptP56388 129 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AbatP61922 500 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 IdsQ08890 552 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Fahd2Q3TC72 313 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp2j13Q3UNV4 503 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ankrd28Q505D1 1053 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cyp2c66Q5GLZ0 490 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Q6GQV0 436 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tas2r106Q7M724 308 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pum1Q80U78 1189 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cox10Q8CFY5 443 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 H2afjQ8R1M2 129 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr390Q8VEZ7 311 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr691Q8VGW5 322 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 AclyQ91V92 1091 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Dio3Q91ZI8 304 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mto1Q923Z3 669 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rassf3Q99P51 232 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Uck2Q99PM9 261 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc25a46Q9CQS4 418 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Med10Q9CXU0 135 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CacybpQ9CXW3 229 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Yae1d1Q9DAY6 216 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Doc2gQ9ESN1 387 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il22Q9JJY9 179 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Nfkb2Q9WTK5 899 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ggps1Q9WTN0 300 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Clec2iQ9WVF9 217 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm45713A0A1B0GS68 446 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Veph1A1A535 833 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm6592A2AHC7 168 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm12666A2AMD0 254 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1303A2AVW1 312 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp40B1B1D3 796 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Prrt4B2RU40 902 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Adamts14E9PX39 1209 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr746E9Q840 314 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NoctO35710 429 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Clec2lP0C7M9 211 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Zfp14P10755 501 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ifrd1P19182 449 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Il1rnP25085 178 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GcgP55095 180 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tbx6P70327 436 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem207P86045 143 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 B3gnt4Q1RLK6 350 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Tmem173Q3TBT3 378 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Sez6l2Q4V9Z5 910 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PtprrQ62132 656 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Grm7Q68ED2 915 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Cntn4Q69Z26 1026 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 PcnpQ6P8I4 178 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pphln1Q8K2H1 381 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 NotumQ8R116 503 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Actr8Q8R2S9 624 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Akr1c13Q8VC28 323 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr771Q8VFH6 317 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1047Q8VGS0 319 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr385Q8VGT1 312 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GgactQ923B0 149 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 CinpQ9D0V8 212 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Snx29Q9D3S3 818 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GOLGA7BQ9D428 167 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Ppil3Q9D6L8 161 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Slc28a3Q9ERH8 703 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Alyref2Q9JJW6 218 aa11.35□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm2237E9Q501 211 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Vmn1r14H3BJ46 303 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Gm3591K7N6X2 186 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 St3gal5O88829 414 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Apoa4P06728 395 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 MtpnP62774 118 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 GaaP70699 953 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr464Q5SW48 313 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 OclnQ61146 521 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 ManeaQ6NXH2 462 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Olfr1308Q7TQX0 320 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Rims3Q80U57 307 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Mppe1Q80XL7 396 aa11.34□□□□□ -0.59
Vamp1-201ENSMUST00000032487 Pramel7Q810Y8 479 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.2 ms