RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	MAPK13	O15264	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	INSIG1	O15503	277 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	EPPIN	O95925	133 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHG3	P01860	377 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM157B	P0CG42	384 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GJB2	P29033	226 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KRT2	P35908	639 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ASPA	P45381	313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB561	P49447	251 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR85	P60893	370 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RHOA	P61586	193 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GUCA2A	Q02747	115 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	NCOA4	Q13772	614 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GRM3	Q14832	879 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	INSC	Q1MX18	579 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BTBD16	Q32M84	506 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SATL1	Q86VE3	508 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR150	Q8NGU9	434 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB34	Q9BZG1	259 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	LDAH	Q9H6V9	325 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	C12orf49	Q9H741	205 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DSCR3	O14972	297 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TMCC1	O94876	653 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FTCD	O95954	541 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SOD1	P00441	154 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN1MW	P04001	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CSF1	P09603	554 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PRTN3	P24158	256 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	HAL	P42357	657 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ARSF	P54793	590 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	EMP2	P54851	167 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DIO3	P55073	304 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GNA12	Q03113	381 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CNGA3	Q16281	694 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	C5orf22	Q49AR2	442 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF550	Q7Z398	422 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GPBP1	Q86WP2	473 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC5A8	Q8N695	610 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8NFD4	153 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	COX14	Q96I36	57 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	NTN4	Q9HB63	628 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FZD10	Q9ULW2	581 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	MATN2	O00339	956 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PIK3R2	O00459	728 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CDK2AP1	O14519	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	CPLX1	O14810	134 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FYN	P06241	537 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	PYGL	P06737	847 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	NR4A2	P43354	598 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGA8	P53708	1063 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	DPT	Q07507	201 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	KHDRBS1	Q07666	443 aa	Known RBP eCLIP	5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	MTA1	Q13330	715 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	MAMLD1	Q13495	774 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	GALNT3	Q14435	633 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SNAP23-223	ENST00000627440	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48

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