RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 TSSK1BQ9BXA7 367 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CDC23Q9UJX2 597 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CSAG2Q9Y5P2 127 aa23.91■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 IQCF5A8MTL0 148 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SOCS6O14544 535 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ADRA1DP25100 572 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 STIP1P31948 543 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GRIA1P42261 906 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 GRIA3P42263 894 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3AQ14563 771 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 FIGLAQ6QHK4 219 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 IGFL2Q6UWQ7 119 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 UNC5DQ6UXZ4 953 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 COX15Q7KZN9 410 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 PPP4R1Q8TF05 950 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF285Q96NJ3 590 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 CUTCQ9NTM9 273 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 NUP210LQ5VU65 1888 aa23.9■■□□□ 1.42
PTPRF-216ENST00000617451 ALOX12BO75342 701 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SLCO2B1O94956 709 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FTCDO95954 541 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 APOA4P06727 396 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 MCM3P25205 808 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 AOAHP28039 575 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 GRM7Q14831 915 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SF1Q15637 639 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 HIF1AQ16665 826 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TCTE1Q5JU00 501 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 KIRREL2Q6UWL6 708 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 RASGRF2O14827 1237 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FDFT1P37268 417 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 OASLQ15646 514 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 NLRP9Q7RTR0 991 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA1328Q86T90 577 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PEX13Q92968 403 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 AGAP4Q96P64 663 aa23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FITM1A5D6W6 292 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FKBP9O95302 570 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF75DP51815 510 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PRAMEP78395 509 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 KCNMB4Q86W47 210 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 KRT222Q8N1A0 295 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 COG1Q8WTW3 980 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 ZUFSPQ96AP4 578 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 HES6Q96HZ4 224 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SELENOSQ9BQE4 189 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 CTSFQ9UBX1 484 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A10Q9ULF5 831 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TCAF1Q9Y4C2 921 aa23.87■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TARM1B6A8C7 271 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 E7EVH7 732 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 LIASO43766 372 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 OR1D4P47884 311 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB14Q8TBM8 379 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 LHPPQ9H008 270 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 SEMA3GQ9NS98 782 aa23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 VSTM2BA6NLU5 285 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 CTSVO60911 334 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 IFNB1P01574 187 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TSFMP43897 325 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 KIF5AQ12840 1032 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TMED2Q15363 201 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 FAM214AQ32MH5 1076 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 TUBB8Q3ZCM7 444 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 PARP9Q8IXQ6 854 aa23.85■■□□□ 1.41
PTPRF-216ENST00000617451 OR11G2Q8NGC1 345 aa23.85■■□□□ 1.41
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