RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	SYCP1	Q15431	976 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	C3AR1	Q16581	482 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SCD5	Q86SK9	330 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SYVN1	Q86TM6	617 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	VPS36	Q86VN1	386 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MCU	Q8NE86	351 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PDXP	Q96GD0	296 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	EPSTI1	Q96J88	318 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FIZ1	Q96SL8	496 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	COMMD8	Q9NX08	183 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SCML2	Q9UQR0	700 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.77	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ATP8B3	O60423	1300 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768		A0A087WWL8	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768		A8MXQ7	604 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	C21orf140	B9A014	251 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CTAG2	O75638	210 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RAF1	P04049	648 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ALPP	P05187	535 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	RALA	P11233	206 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	EGR1	P18146	543 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NNMT	P40261	264 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NDST1	P52848	882 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DMPK	Q09013	629 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CDH18	Q13634	790 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KEAP1	Q14145	624 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC39A14	Q15043	492 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768		Q5PR19	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ADAL	Q6DHV7	355 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	BCORP1	Q8N888	145 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SDCCAG3	Q96C92	435 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HPDL	Q96IR7	371 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KL	Q9UEF7	1012 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.76	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768		H0YIZ8	118 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MCF2L	O15068	1137 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	AP1G1	O43747	822 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	IL18RAP	O95256	599 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	MOCS3	O95396	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	CERS1	P27544	350 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	HTR1B	P28222	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	DDIT3	P35638	169 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	LIPA	P38571	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	KCNJ5	P48544	419 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SLC11A2	P49281	568 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF131	P52739	623 aa		4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
MLH1-223	ENST00000616768	SRP54	P61011	504 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65

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