RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAL1Q4LDG9 190 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 KRT77Q7Z794 578 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR6P1Q8NGX9 317 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GPBAR1Q8TDU6 330 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GSDMCQ9BYG8 508 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC40Q9H9A6 602 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRIM39Q9HCM9 518 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 THAP1Q9NVV9 213 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF10CO14798 259 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 XIAPP98170 497 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A3Q00325 362 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ANKRD49Q8WVL7 239 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC10Q969S8 669 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 NDE1Q9NXR1 346 aa12.23□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SDR42E2A6NKP2 422 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TPP1O14773 563 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BIRC5O15392 142 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MGAT1P26572 445 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GMPRP36959 345 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINB9P50453 376 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PDX1P52945 283 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF765Q7L2R6 523 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF438Q7Z4V0 828 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR156Q8NFN8 814 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GATA6Q92908 595 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CRELD1Q96HD1 420 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RAXQ9Y2V3 346 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM208BQ5VWN6 2430 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SCN8AQ9UQD0 1980 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SPTA1P02549 2419 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC162PA2VCL2 907 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RHPN2P1A8MT19 583 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 IQCF5A8MTL0 148 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TAF4O00268 1085 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 B4GAT1O43505 415 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 POP7O75817 140 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ITIH1P19827 911 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TPSB2P20231 275 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 BPIFB3P59826 476 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AP2B1P63010 937 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CBLBQ13191 982 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TPSAB1Q15661 275 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf28Q4W4Y0 310 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MFSD3Q96ES6 412 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 EMCNQ9ULC0 261 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SOX13Q9UN79 622 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PSAT1Q9Y617 370 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PRSS21Q9Y6M0 314 aa12.22□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CRTAMO95727 393 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FESP07332 822 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTA2P09210 222 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC18P0CG32 403 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CPOXP36551 454 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SPIDRQ14159 915 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 PHF19Q5T6S3 580 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXB2Q5VYV0 432 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCNJLQ8IV13 435 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM181AQ8N9Y4 354 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 OR13J1Q8NGT2 312 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA6CQ9H3T2 930 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 SYBUQ9NX95 663 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 MOCS1Q9NZB8 636 aa12.21□□□□□ -0.45
RABGEF1-209ENST00000607882 AHCYL1O43865 530 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 MSH3P20585 1137 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 NMBRP28336 390 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PREPP48147 710 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC1A6P48664 564 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PDE1BQ01064 536 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 FOXK2Q01167 660 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SEMA3AQ14563 771 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRC36Q1X8D7 754 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf48Q6RUI8 117 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 ATG14Q6ZNE5 492 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 LRRTM4Q86VH4 590 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 SERPINA9Q86WD7 417 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
RABGEF1-209ENST00000607882 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms