RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 NKAIN2Q5VXU1 208 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ARMC6Q6NXE6 501 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 OR56A3Q8NH54 315 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 UBTD2Q8WUN7 234 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CCDC126Q96EE4 140 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PHF21BQ96EK2 531 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 MED8Q96G25 268 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 OGFRQ9NZT2 677 aa14.69□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PIPSLA2A3N6 862 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 GSAPA4D1B5 854 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 C2orf74A8MZ97 194 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ISM1B1AKI9 464 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 H3BQF6 201 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 MATN2O00339 956 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 STX16O14662 325 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 STK16O75716 305 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CCND1P24385 295 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SLC6A12P48065 614 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 HSPA7P48741 367 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 AGTR2P50052 363 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TBPL1P62380 186 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PPP2R2AP63151 447 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 KIR2DS3Q14952 304 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PCLAFQ15004 111 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SUSD1Q6UWL2 747 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 DEFB124Q8NES8 71 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ESAMQ96AP7 390 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SLC22A18Q96BI1 424 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PYCR2Q96C36 320 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CD244Q9BZW8 370 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ZMYND15Q9H091 742 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ABCF3Q9NUQ8 709 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ACTR10Q9NZ32 417 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa14.68□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 A0A1W2PPV9 198 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SLC30A4O14863 429 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 WDR47O94967 919 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 DHRS4L1P0CG22 281 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 NR1D1P20393 614 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 KCNA4P22459 653 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CD1CP29017 333 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 GDF5P43026 501 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PRKAA2P54646 552 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CCL7P80098 99 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ILKQ13418 452 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 HHATQ5VTY9 493 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 GLRX5Q86SX6 157 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 MGARPQ8TDB4 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 NCSTNQ92542 709 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SGPP1Q9BX95 441 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 RAB33BQ9H082 229 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 OXSMQ9NWU1 459 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.67□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 A0A1W2PQM1 296 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 TM4SF5O14894 197 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 RFPL3O75679 317 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 BPGMP07738 259 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 UGT2B7P16662 529 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 IMPDH1P20839 514 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 PSMB5P28074 263 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ALDH3A1P30838 453 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 SERPINB4P48594 390 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 HERVK_113P63132 956 aa14.66□□□□□ -0.06
ATG4D-211ENST00000589753 ASPHQ12797 758 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms