RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 ARMCX1Q9P291 453 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CHEK2O96017 543 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 HTR6P50406 440 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF542PQ5EBM4 170 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 XKR7Q5GH72 579 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 DDIASQ8IXT1 998 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 MVB12BQ9H7P6 319 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 SPATA7Q9P0W8 599 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 KNL1Q8NG31 2342 aa25.23■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP6AP2O75787 350 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 WFS1O76024 890 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 LINC00032P0C843 101 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 HALP42357 657 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 BNIP1Q12981 228 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CYP2A13Q16696 494 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC106Q9BWC9 280 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC29A3Q9BZD2 475 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa25.22■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM221A6NGB7 291 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CAPN14A8MX76 684 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 M0R296 226 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0754O94854 1291 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 HSD17B2P37059 387 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM198Q66K66 360 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 NXNQ6DKJ4 435 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 PHACTR4Q8IZ21 702 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CCT7Q99832 543 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF385DQ9H6B1 395 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 POLG2Q9UHN1 485 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM33Q9UPN9 1127 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 E7EQ34 232 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 TLR4O00206 839 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 LAMTOR5O43504 91 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 UGDHO60701 494 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 F3P13726 295 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 NPPBP16860 134 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 HMOX2P30519 316 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 E2F2Q14209 437 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF165Q6ZSG1 346 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 CHSY3Q70JA7 882 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 AKTIPQ9H8T0 292 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 GPRC5BQ9NZH0 403 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa25.21■■□□□ 1.63
SCAMP4-210ENST00000588555 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CD22P20273 847 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 BLKP51451 505 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CHIT1Q13231 466 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SCIMPQ6UWF3 145 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TREML1Q86YW5 311 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC12A4Q9UP95 1085 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNE2Q9Y6J6 123 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC28Q96AY4 2481 aa25.2■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 FFAR3O14843 346 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR42O15529 346 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ABRAXAS2Q15018 415 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 C1orf210Q8IVY1 113 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LINC01555Q8NAE3 123 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 OR2T11Q8NH01 316 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 NEIL2Q969S2 332 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GSDMCQ9BYG8 508 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 SH2B3Q9UQQ2 575 aa25.19■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PRR35P0CG20 571 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 T-ENOLP0DO92 83 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GNAZP19086 355 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CCND1P24385 295 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 IRF8Q02556 426 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 KRT72Q14CN4 511 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LIPJQ5W064 366 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 ARMCX6Q7L4S7 300 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 LONP2Q86WA8 852 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM105Q8N8V8 129 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 OR52E1Q8NGJ3 308 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 USP7Q93009 1102 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 MIPEPQ99797 713 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 GIMAP2Q9UG22 337 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 THADAQ6YHU6 1953 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 MANBAO00462 879 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 CSF2P04141 144 aa25.18■■□□□ 1.62
SCAMP4-210ENST00000588555 JUPP14923 745 aa25.18■■□□□ 1.62
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